27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1839 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1839  hypothetical protein  100 
 
 		 123 aa  241  1.9999999999999999e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124556  normal  0.17507 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2497  hypothetical protein  65.85 
 
 		 124 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.404496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1825  hypothetical protein  65.85 
 
 		 124 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0194222  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1788  hypothetical protein  65.85 
 
 		 124 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.722398  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1645  hypothetical protein  66.39 
 
 		 142 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1781  hypothetical protein  65.85 
 
 		 124 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0111743  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2167  hypothetical protein  66.67 
 
 		 123 aa  166  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1753  hypothetical protein  67.48 
 
 		 125 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.819388  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2439  hypothetical protein  69.92 
 
 		 123 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685345 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2872  hypothetical protein  65.85 
 
 		 124 aa  157  4e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1969  hypothetical protein  67.21 
 
 		 123 aa  155  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00366875  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1693  hypothetical protein  63.11 
 
 		 140 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.337002  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2349  hypothetical protein  67.48 
 
 		 126 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0136957  decreased coverage  0.000000000361738 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2421  hypothetical protein  66.67 
 
 		 126 aa  138  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0112375  hitchhiker  0.000913176 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1647  hypothetical protein  65.04 
 
 		 126 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1915  hypothetical protein  55.74 
 
 		 130 aa  103  7e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.130481  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3192  hypothetical protein  38.89 
 
 		 131 aa  90.9  5e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0660225  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02145  hypothetical protein  40 
 
 		 140 aa  83.6  7e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0123559  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1747  hypothetical protein  53.16 
 
 		 145 aa  81.3  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2486  hypothetical protein  49.28 
 
 		 142 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2386  hypothetical protein  53.62 
 
 		 146 aa  76.6  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1072  hypothetical protein  34.13 
 
 		 129 aa  75.9  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.105151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03196  hypothetical protein  50 
 
 		 127 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002785  hypothetical protein  48.84 
 
 		 146 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0706  putative transmembrane protein  30.63 
 
 		 125 aa  45.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.445384  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1669  membrane protein-like protein  32.88 
 
 		 135 aa  40.8  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1980  hypothetical protein  34.67 
 
 		 115 aa  40.4  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.820316  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>