18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1105 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1105  type IV pilus assembly protein PilX  100 
 
 		 144 aa  286  7e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.711381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1200  type IV pilus assembly protein PilX  76.39 
 
 		 144 aa  230  6e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00971414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1065  type IV pilus assembly protein PilX  74.31 
 
 		 144 aa  218  3e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2951  type IV pilus assembly protein PilX  69.33 
 
 		 150 aa  216  7.999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.114107  normal  0.117946 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1162  type IV pilus assembly protein PilX  58.82 
 
 		 153 aa  184  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.834518 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3229  hypothetical protein  58.17 
 
 		 153 aa  183  7e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1060  type IV pilus assembly protein PilX  58.17 
 
 		 153 aa  183  8e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1127  type IV pilus assembly protein PilX  57.52 
 
 		 153 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3526  hypothetical protein  57.52 
 
 		 153 aa  180  8.000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3130  type IV pilus assembly protein PilX  57.24 
 
 		 153 aa  177  4e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.706597 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1297  type IV pilus assembly protein PilX  58.62 
 
 		 142 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.627345 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3033  type IV pilus assembly protein PilX  54.55 
 
 		 156 aa  163  8e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0748735 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0930  type IV pilus assembly protein PilX  54.55 
 
 		 156 aa  159  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.881011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1089  type IV pilus assembly protein PilX  52.74 
 
 		 145 aa  158  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2884  type IV pilus assembly protein PilX  51.03 
 
 		 150 aa  136  1e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.245719  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2717  type IV pilus assembly protein PilX  52.11 
 
 		 142 aa  105  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1215  hypothetical protein  27.85 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.684436  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2559  Tfp pilus assembly protein PilX-like  40 
 
 		 213 aa  41.6  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0751732  normal  0.24266 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>