106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3949 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008345  Sfri_3949  phospholipid/glycerol acyltransferase  100 
 
 
184 aa  378  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0119  phospholipid/glycerol acyltransferase  69.61 
 
 
186 aa  266  2e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0963438 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0119  phospholipid/glycerol acyltransferase  69.61 
 
 
186 aa  266  2e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0038904 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4235  phospholipid/glycerol acyltransferase  67.4 
 
 
187 aa  266  2e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0119  phospholipid/glycerol acyltransferase  67.4 
 
 
187 aa  266  2e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0124  phospholipid/glycerol acyltransferase  67.4 
 
 
187 aa  265  2e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0123  phospholipid/glycerol acyltransferase  67.4 
 
 
187 aa  266  2e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3750  phospholipid/glycerol acyltransferase  67.03 
 
 
183 aa  265  2.9999999999999995e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00144073 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4156  phospholipid/glycerol acyltransferase  67.4 
 
 
183 aa  265  2.9999999999999995e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0114  phospholipid/glycerol acyltransferase  69.06 
 
 
186 aa  264  5e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.602427 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0123  acyltransferase family protein  68.51 
 
 
186 aa  260  6e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0120  phospholipid/glycerol acyltransferase  65.19 
 
 
187 aa  260  6.999999999999999e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.179228  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0088  phospholipid/glycerol acyltransferase  63.39 
 
 
184 aa  259  2e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4832  phospholipid/glycerol acyltransferase  64.09 
 
 
214 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3630  acyltransferase family protein  61.33 
 
 
183 aa  245  3e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4440  phospholipid/glycerol acyltransferase  59.34 
 
 
189 aa  238  4e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.439449  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2191  hypothetical protein  51.65 
 
 
187 aa  201  5e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2219  hypothetical protein  51.65 
 
 
187 aa  199  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3447  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.7 
 
 
188 aa  147  9e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2802  phospholipid/glycerol acyltransferase  43.37 
 
 
183 aa  145  3e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.606207  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01012  Acyltransferase family protein  37.14 
 
 
211 aa  139  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.501742  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04680  hypothetical protein  41.67 
 
 
192 aa  136  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0451  hypothetical protein  41.67 
 
 
192 aa  135  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4020  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.29 
 
 
210 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0561  phospholipid/glycerol acyltransferase  39.16 
 
 
203 aa  129  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.233184  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2166  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.93 
 
 
205 aa  128  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.881132  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4196  phospholipid/glycerol acyltransferase  40.11 
 
 
192 aa  127  9.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1712  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.57 
 
 
205 aa  125  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10462  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1355  acyltransferase, putative  38.69 
 
 
176 aa  121  6e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02764  acyltransferase  36.97 
 
 
209 aa  117  7e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.229427  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1783  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.96 
 
 
173 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.175926  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0958  phospholipid/glycerol acyltransferase  40.46 
 
 
198 aa  115  3e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.138738 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0168  hypothetical protein  38.55 
 
 
209 aa  115  3e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0148  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.24 
 
 
209 aa  115  3e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0488  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.84 
 
 
188 aa  115  5e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37610  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  39.41 
 
 
203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2245  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.75 
 
 
208 aa  113  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0239387  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2670  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.69 
 
 
204 aa  111  5e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0440614 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2093  hypothetical protein  34.1 
 
 
244 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.821432  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2413  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.68 
 
 
244 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4324  phospholipid/glycerol acyltransferase  42.11 
 
 
200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.270681 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2518  pseudouridine synthase, RluD  33.73 
 
 
201 aa  108  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0677  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.83 
 
 
185 aa  107  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0180  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.11 
 
 
200 aa  107  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2254  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.37 
 
 
221 aa  106  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1051  hypothetical protein  33.33 
 
 
191 aa  106  2e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.961359 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1033  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.15 
 
 
210 aa  105  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22670  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  32.39 
 
 
197 aa  97.8  7e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0134  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.57 
 
 
191 aa  97.4  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3457  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.16 
 
 
199 aa  94  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0632621 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2517  phospholipid/glycerol acyltransferase  36 
 
 
201 aa  93.6  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.38065  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3737  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.72 
 
 
193 aa  87.4  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0472119 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0195  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.91 
 
 
172 aa  84  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.379626  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0997  acyltransferase family protein  32.35 
 
 
290 aa  80.9  0.000000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.195621  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1325  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.97 
 
 
203 aa  75.1  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0644  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  30.43 
 
 
235 aa  57  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.54251e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1153  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  31.58 
 
 
194 aa  56.6  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3386  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  30.38 
 
 
196 aa  57  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000418539  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2270  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.65 
 
 
239 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000119102  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2086  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.65 
 
 
239 aa  53.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000321882  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2026  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.65 
 
 
239 aa  53.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  5.718399999999999e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2240  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.65 
 
 
239 aa  53.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101928  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2352  putative 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.24 
 
 
239 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000249527  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2223  putative 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.24 
 
 
239 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000296239  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2267  putative 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.65 
 
 
239 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.1632600000000004e-34 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2024  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.24 
 
 
239 aa  52  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000109948  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3101  putative 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.24 
 
 
239 aa  52  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000192666  hitchhiker  6.55431e-16 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1020  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.24 
 
 
200 aa  50.4  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2101  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  30.22 
 
 
194 aa  50.1  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.428689 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2065  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.06 
 
 
239 aa  48.9  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000189855  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1453  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.19 
 
 
239 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1844  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  26.14 
 
 
237 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3400  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.46 
 
 
254 aa  48.1  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0026  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.59 
 
 
214 aa  48.1  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1078  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.62 
 
 
1226 aa  46.2  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0508  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  29.01 
 
 
257 aa  46.2  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.216043 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3866  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  25.57 
 
 
237 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.102376 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3537  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.21 
 
 
250 aa  44.3  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0406833 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0579  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.66 
 
 
259 aa  43.9  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1202  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  32.71 
 
 
212 aa  43.9  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.11547  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1470  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.82 
 
 
211 aa  43.9  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.151456  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4653  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  30.33 
 
 
493 aa  43.9  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1579  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.68 
 
 
252 aa  43.9  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.555028  normal  0.473826 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1422  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  25.68 
 
 
237 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475615  normal  0.655993 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3227  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.78 
 
 
252 aa  43.5  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000000123121  hitchhiker  0.0000289484 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0670  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.66 
 
 
255 aa  42.7  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.776916  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2828  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  38.2 
 
 
244 aa  42.4  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0569  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  30.09 
 
 
260 aa  42.4  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3461  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  30.09 
 
 
260 aa  42.7  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1330  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferases  27.14 
 
 
193 aa  42.4  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000270973  normal  0.0367266 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0568  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  30.09 
 
 
260 aa  42.4  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.73546  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1643  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  21.95 
 
 
241 aa  42.4  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000254888  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1881  1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase  25.4 
 
 
246 aa  42.4  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03651  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  31.58 
 
 
241 aa  42  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2621  phospholipid/glycerol acyltransferase  23.72 
 
 
254 aa  41.6  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.741388  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2052  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.36 
 
 
257 aa  42  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.850396  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0522  putative acyltransferase transmembrane protein  25.36 
 
 
250 aa  41.6  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00553836 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0582  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase, putative  23.33 
 
 
259 aa  41.6  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2756  phospholipid/glycerol acyltransferase  23.72 
 
 
254 aa  41.6  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.594661  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0450  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  26.67 
 
 
244 aa  41.6  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.644078  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>