24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2546 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2546  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  237  2.9999999999999997e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.211724  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0137  hypothetical protein  61.82 
 
 		 118 aa  142  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1819  hypothetical protein  63.54 
 
 		 100 aa  136  8.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0698228  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2221  hypothetical protein  73.75 
 
 		 95 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00323479  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2318  hypothetical protein  67.06 
 
 		 100 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0856  hypothetical protein  63.86 
 
 		 97 aa  125  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3321  hypothetical protein  64.37 
 
 		 96 aa  124  5e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2552  hypothetical protein  67.9 
 
 		 96 aa  123  7e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4743  hypothetical protein  72.6 
 
 		 101 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.369246  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1958  hypothetical protein  61.36 
 
 		 104 aa  117  6e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.781957  normal  0.865529 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1930  hypothetical protein  65.43 
 
 		 100 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4057  hypothetical protein  68.12 
 
 		 96 aa  108  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1114  hypothetical protein  69.57 
 
 		 74 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0954  hypothetical protein  69.57 
 
 		 74 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003649  hypothetical protein  66.18 
 
 		 69 aa  102  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.13895  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2938  protein of unknown function UPF0153  35 
 
 		 134 aa  88.6  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0781616  normal  0.823216 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04095  hypothetical protein  40.98 
 
 		 83 aa  50.4  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1797  protein of unknown function UPF0153  31.91 
 
 		 219 aa  49.3  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.370926  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1877  hypothetical protein  42.42 
 
 		 224 aa  47.4  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4386  protein of unknown function UPF0153  32.35 
 
 		 228 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365173  normal  0.783994 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0768  protein of unknown function UPF0153  33.33 
 
 		 198 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.932399 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0950  hypothetical protein  53.33 
 
 		 115 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10191  Fe-S-cluster oxidoreductase  53.33 
 
 		 115 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09261  Fe-S-cluster oxidoreductase  37.68 
 
 		 115 aa  40  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>