50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A4566 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A4566  hypothetical protein  100 
 
 		 301 aa  618  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.859711  normal  0.266567 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4658  hypothetical protein  99.34 
 
 		 301 aa  614  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4657  hypothetical protein  99 
 
 		 301 aa  613  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4706  SdiA-regulated family protein  98.95 
 
 		 286 aa  579  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4573  sdiA-regulated family protein  98.95 
 
 		 286 aa  579  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3272  SdiA-regulated protein  36.57 
 
 		 325 aa  169  5e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4878  SdiA-regulated protein  34.59 
 
 		 329 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.60346 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4933  hypothetical protein  35.17 
 
 		 323 aa  163  3e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4561  hypothetical protein  34.86 
 
 		 323 aa  162  7e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3731  SdiA-regulated domain-containing protein  34.86 
 
 		 286 aa  161  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00663861  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04165  hypothetical protein  34.51 
 
 		 322 aa  161  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00151161  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04202  hypothetical protein  34.51 
 
 		 322 aa  161  2e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00228683  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5845  SdiA-regulated protein  34.03 
 
 		 280 aa  160  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.539509 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4227  SdiA-regulated domain-containing protein  36.61 
 
 		 303 aa  160  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3663  SdiA-regulated domain protein  34.15 
 
 		 323 aa  160  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000154748  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38420  hypothetical protein  35.45 
 
 		 309 aa  158  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.224716 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4772  conserved hypothetical protein yjiK  34.51 
 
 		 323 aa  157  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22840  SdiA-regulated domain-containing protein  36.4 
 
 		 308 aa  157  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0239521  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5204  SdiA-regulated domain-containing protein  32.56 
 
 		 300 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07110  hypothetical protein  35.02 
 
 		 317 aa  152  5.9999999999999996e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.187526  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5151  SdiA-regulated domain protein  33.59 
 
 		 300 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.965879  normal  0.786945 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0314  SdiA-regulated domain-containing protein  33.46 
 
 		 303 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.183725 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5058  SdiA-regulated domain-containing protein  33.59 
 
 		 300 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0993064  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5290  hypothetical protein  34.98 
 
 		 312 aa  149  5e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.842454  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5383  SdiA-regulated  34.23 
 
 		 305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.02449 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4848  SdiA-regulated  33.21 
 
 		 317 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0418  hypothetical protein  33.84 
 
 		 321 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04270  putative transcriptional regulator  34.22 
 
 		 321 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.510674  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5589  hypothetical protein  35.29 
 
 		 326 aa  139  6e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4229  SdiA-regulated domain-containing protein  34.86 
 
 		 317 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5110  SdiA-regulated  35.66 
 
 		 326 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5082  sdiA-regulated domain protein  34.29 
 
 		 272 aa  130  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.142061 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04160  putatitve transcriptional regulator  33.57 
 
 		 329 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0412  putatitve transcriptional regulator  35.1 
 
 		 310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.470848  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0044  SrgB  34.87 
 
 		 282 aa  125  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.880775 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4588  SrgB  34.87 
 
 		 282 aa  125  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.537966  normal  0.854638 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0313  SdiA-regulated domain-containing protein  31.43 
 
 		 306 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.124016 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4679  hypothetical protein  34.03 
 
 		 282 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5205  SdiA-regulated domain-containing protein  31.38 
 
 		 305 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.520929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5059  SdiA-regulated domain-containing protein  31.79 
 
 		 306 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.181452  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48290  hypothetical protein  29.96 
 
 		 305 aa  122  8e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4849  SdiA-regulated  31.6 
 
 		 314 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5152  SdiA-regulated domain protein  31.07 
 
 		 306 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.767361 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5291  hypothetical protein  29.97 
 
 		 310 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5384  SdiA-regulated  30.5 
 
 		 307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0252012 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2428  hypothetical protein  25.46 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0451472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1215  inner membrane protein  25 
 
 		 280 aa  65.9  0.0000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1269  inner membrane protein  27.16 
 
 		 268 aa  48.5  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1216  hypothetical protein  27.27 
 
 		 302 aa  44.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.256676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3751  hypothetical protein  24.78 
 
 		 276 aa  42.7  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>