13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A1439 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A1439  gifsy-2 prophage protein  100 
 
 		 87 aa  182  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.282953 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2079  gifsy-2 prophage protein  98.85 
 
 		 87 aa  180  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2018  hypothetical protein  97.7 
 
 		 163 aa  178  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.946251 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2024  gifsy-2 prophage protein  97.7 
 
 		 87 aa  177  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0390474 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3137  bacteriophage terminase, small subunit  58.62 
 
 		 158 aa  99.8  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000361643 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1067  gifsy-2 prophage protein  47.13 
 
 		 177 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000488797 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1139  gifsy-2 prophage protein  47.13 
 
 		 177 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1404  gifsy-2 prophage protein  47.13 
 
 		 177 aa  86.7  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000325314 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0895  bacteriophage DNA packaging protein; terminase, small subunit  50.57 
 
 		 163 aa  77.4  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1860  bacteriophage terminase, small subunit  45.98 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000318821 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3206  bacteriophage terminase, small subunit  45.98 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0031617 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1640  hypothetical protein  36.71 
 
 		 175 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0185618  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0691  hypothetical protein  36.25 
 
 		 165 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000196808 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>