22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A0861 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A0861  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  100 
 
 		 69 aa  131  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0802  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  95.65 
 
 		 69 aa  102  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3545  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  84.62 
 
 		 80 aa  101  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3713  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  80 
 
 		 80 aa  97.8  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0061  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  78.46 
 
 		 79 aa  97.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.979623  normal  0.547366 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0061  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  78.46 
 
 		 79 aa  97.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.493404 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0062  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  78.46 
 
 		 79 aa  97.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0893  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  91.3 
 
 		 68 aa  96.7  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3544  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  76.92 
 
 		 80 aa  93.6  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0830  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  96.92 
 
 		 68 aa  90.1  9e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3616  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  80 
 
 		 80 aa  82.8  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.384488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0063  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  78.46 
 
 		 79 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3651  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  76.79 
 
 		 80 aa  80.1  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0060  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  73.21 
 
 		 79 aa  77.4  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.130142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0201  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  50 
 
 		 85 aa  63.5  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.41736  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3624  sodium pump decarboxylase, gamma subunit  47.06 
 
 		 83 aa  53.9  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000194054  decreased coverage  0.0000000418029 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0692  sodium pump decarboxylase, gamma subunit  51.52 
 
 		 80 aa  54.3  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0321  putative oxaloacetate decarboxylase, gamma subunit  40.58 
 
 		 112 aa  47.8  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1260  pyruvate carboxylase/oxaloacetate decarboxylase gamma subunit  39.39 
 
 		 79 aa  47.4  0.00007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.406933  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1305  ribonuclease D  44.78 
 
 		 80 aa  47  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00021107  normal  0.0271144 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002524  oxaloacetate decarboxylase gamma chain  36.36 
 
 		 85 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0628389  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03492  oxaloacetate decarboxylase subunit gamma  34.29 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>