30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B3226 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011149  SeAg_B3226    100 
 
 
183 bp  363  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.012048  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3303  hypothetical protein  97.22 
 
 
207 bp  190  9e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3300  hypothetical protein  100 
 
 
126 bp  87.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3405  hypothetical protein  97.73 
 
 
126 bp  79.8  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0887759  normal  0.104598 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4496  hypothetical protein  100 
 
 
150 bp  67.9  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.560368  normal  0.146153 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4642  hypothetical protein  96.88 
 
 
132 bp  56  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.943406  normal  0.202422 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0535  hypothetical protein  94.44 
 
 
141 bp  56  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4591  hypothetical protein  96.88 
 
 
132 bp  56  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.398164  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0534  hypothetical protein  94.12 
 
 
141 bp  52  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4534  formate-dependent nitrite reductase complex subunit NrfF  94.12 
 
 
510 bp  52  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4625  formate-dependent nitrite reductase complex subunit NrfF  94.12 
 
 
510 bp  52  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.773525  normal  0.804326 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0594  hypothetical protein  94.12 
 
 
141 bp  52  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4252  hypothetical protein  94.74 
 
 
114 bp  52  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.119945  normal  0.106778 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0540  hypothetical protein  94.12 
 
 
141 bp  52  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0723198  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4590  hypothetical protein  93.75 
 
 
132 bp  48.1  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.897274  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4343    94.29 
 
 
114 bp  46.1  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.870413  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4094  hypothetical protein  94.29 
 
 
183 bp  46.1  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0005    94.29 
 
 
411 bp  46.1  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.820621  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4739  hypothetical protein  94.29 
 
 
138 bp  46.1  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.662554  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4476  hypothetical protein  94.29 
 
 
117 bp  46.1  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.540119  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4388    94.29 
 
 
114 bp  46.1  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0191857  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3252  hypothetical protein  94.29 
 
 
177 bp  46.1  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0602    94.29 
 
 
120 bp  46.1  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4423  hypothetical protein  94.29 
 
 
138 bp  46.1  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4171  hypothetical protein  94.29 
 
 
117 bp  46.1  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4093  hypothetical protein  94.29 
 
 
114 bp  46.1  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.198281  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3693  hypothetical protein  94.29 
 
 
129 bp  46.1  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3579  hypothetical protein  94.29 
 
 
246 bp  46.1  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.76094  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3375  hypothetical protein  94.29 
 
 
141 bp  46.1  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000276807  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0006  hypothetical protein  94.29 
 
 
411 bp  46.1  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.581091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>