22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2797 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_2797  acyltransferase 3  100 
 
 
363 aa  725    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0792  hypothetical protein  30.03 
 
 
359 aa  117  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.298441  normal  0.0360506 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1380  hypothetical protein  30.28 
 
 
321 aa  103  6e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.786153 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3659  hypothetical protein  26.94 
 
 
346 aa  97.1  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1771  acyltransferase 3  27.7 
 
 
345 aa  85.9  9e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1158  acyltransferase 3  26.02 
 
 
385 aa  85.9  9e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00977171  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2178  acyltransferase domain, membrane protein  26.52 
 
 
348 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0102  acyltransferase 3  26.58 
 
 
368 aa  75.9  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0248047  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3331  hypothetical protein  28.53 
 
 
349 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3675  acyltransferase 3  26.54 
 
 
345 aa  65.1  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3653  acyltransferase 3  26.39 
 
 
345 aa  64.3  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4165  acyltransferase 3  25.83 
 
 
345 aa  63.9  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0291  acyltransferase 3  27.42 
 
 
345 aa  63.5  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3865  acyltransferase 3  26.83 
 
 
345 aa  63.2  0.000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00949933 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4078  acyltransferase 3  25.49 
 
 
345 aa  62.8  0.000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3970  acyltransferase 3  25.49 
 
 
345 aa  62.8  0.000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4047  acyltransferase 3  25.56 
 
 
345 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0320  hypothetical protein  24.52 
 
 
335 aa  60.5  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1141  acyltransferase 3  25.53 
 
 
361 aa  59.7  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.283735  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3292  hypothetical protein  22.41 
 
 
336 aa  47  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.630097 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1873  acyltransferase 3  22.82 
 
 
349 aa  43.9  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.358353 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0172  hypothetical protein  20.09 
 
 
359 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000866641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>