62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2412 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2412  hypothetical protein  100 
 
 		 198 aa  390  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000204833  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2614  hypothetical protein  87.37 
 
 		 198 aa  353  1e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1620  hypothetical protein  85.86 
 
 		 198 aa  350  1e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00150531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1597  hypothetical protein  85.86 
 
 		 198 aa  350  1e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.141069  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2757  protein of unknown function DUF1282  85.86 
 
 		 198 aa  348  3e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.002843  normal  0.0623291 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1586  hypothetical protein  85.35 
 
 		 198 aa  348  4e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000135398  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2668  hypothetical protein  84.34 
 
 		 198 aa  345  2e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.127943  normal  0.189722 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2502  hypothetical protein  84.34 
 
 		 198 aa  346  2e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0019326  normal  0.0107231 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2570  hypothetical protein  84.34 
 
 		 198 aa  345  2e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0732957  normal  0.0233457 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1787  hypothetical protein  83.33 
 
 		 198 aa  343  1e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1483  hypothetical protein  83.33 
 
 		 198 aa  342  2.9999999999999997e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.262536  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1217  hypothetical protein  82.32 
 
 		 198 aa  335  2.9999999999999997e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.431766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2515  hypothetical protein  81.82 
 
 		 198 aa  334  5.999999999999999e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000188858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2688  hypothetical protein  81.31 
 
 		 198 aa  333  7e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000021601  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1534  hypothetical protein  82.32 
 
 		 198 aa  333  9e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.113804 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3120  hypothetical protein  80.81 
 
 		 198 aa  330  7.000000000000001e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.148578  hitchhiker  0.0000028856 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1610  hypothetical protein  67.35 
 
 		 199 aa  267  8e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.843769  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3797  hypothetical protein  65.13 
 
 		 199 aa  266  2e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.532295  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01961  hypothetical protein  61.73 
 
 		 199 aa  249  2e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000520439  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2964  hypothetical protein  51.02 
 
 		 199 aa  191  8e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.177485  normal  0.0208011 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33240  hypothetical protein  49.74 
 
 		 199 aa  182  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0765852  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1242  hypothetical protein  47.96 
 
 		 199 aa  180  1e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000574212 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49050  hypothetical protein  48.72 
 
 		 199 aa  179  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00210087  hitchhiker  0.0000000540119 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4189  hypothetical protein  48.72 
 
 		 199 aa  179  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181748  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4077  hypothetical protein  47.45 
 
 		 199 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.974663 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1202  hypothetical protein  46.94 
 
 		 199 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1640  hypothetical protein  47.45 
 
 		 199 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.888864  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4233  hypothetical protein  45.69 
 
 		 209 aa  175  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.483786 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3610  hypothetical protein  44.72 
 
 		 203 aa  170  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.21626  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3158  rod shape-determining protein MreC, subtype  38 
 
 		 205 aa  151  5.9999999999999996e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2314  inner membrane protein YohC  39.58 
 
 		 195 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.691053  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2407  inner membrane protein YohC  39.58 
 
 		 195 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.100146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2403  hypothetical protein  39.58 
 
 		 195 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2358  inner membrane protein YohC  39.58 
 
 		 195 aa  150  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2515  inner membrane protein YohC  39.06 
 
 		 195 aa  148  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2735  hypothetical protein  40.1 
 
 		 195 aa  145  4.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2391  hypothetical protein  38.54 
 
 		 200 aa  142  4e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3261  hypothetical protein  38.54 
 
 		 203 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00830166 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1512  hypothetical protein  38.54 
 
 		 195 aa  139  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0909  hypothetical protein  38.54 
 
 		 195 aa  139  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.334035  normal  0.242601 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2425  hypothetical protein  38.54 
 
 		 195 aa  139  3e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2270  hypothetical protein  38.54 
 
 		 195 aa  139  3e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1522  protein of unknown function DUF1282  38.54 
 
 		 195 aa  139  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02065  predicted inner membrane protein  38.02 
 
 		 195 aa  136  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02023  hypothetical protein  38.02 
 
 		 195 aa  136  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3980  hypothetical protein  37.5 
 
 		 203 aa  135  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.238019  normal  0.279719 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1363  hypothetical protein  38.46 
 
 		 196 aa  135  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1885  hypothetical protein  35.67 
 
 		 196 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.491712  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2549  hypothetical protein  35.67 
 
 		 196 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1777  hypothetical protein  35.67 
 
 		 196 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0836  hypothetical protein  38.02 
 
 		 191 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2694  hypothetical protein  40.54 
 
 		 203 aa  124  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674037 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2965  hypothetical protein  33.85 
 
 		 220 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0226639  normal  0.0742439 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2547  hypothetical protein  31.41 
 
 		 204 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0148102 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2361  hypothetical protein  30.89 
 
 		 204 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.63262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1097  hypothetical protein  28.32 
 
 		 209 aa  64.7  0.0000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3124  hypothetical protein  24.72 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36410  hypothetical protein  27.94 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.433568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3224  hypothetical protein  28.49 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.067185 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3567  hypothetical protein  27.14 
 
 		 408 aa  45.1  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.129707  normal  0.931427 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2890  protein of unknown function DUF1282  27.14 
 
 		 408 aa  45.1  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2505  hypothetical protein  29.71 
 
 		 395 aa  45.4  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.331817  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>