22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2221 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2221  hypothetical protein  100 
 
 		 95 aa  196  6e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00323479  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3321  hypothetical protein  71.58 
 
 		 96 aa  149  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2318  hypothetical protein  70.83 
 
 		 100 aa  139  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1819  hypothetical protein  68.48 
 
 		 100 aa  137  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0698228  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2552  hypothetical protein  67.39 
 
 		 96 aa  136  7.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0137  hypothetical protein  76.25 
 
 		 118 aa  134  5e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2546  hypothetical protein  73.75 
 
 		 115 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.211724  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1930  hypothetical protein  63.16 
 
 		 100 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0856  hypothetical protein  59.78 
 
 		 97 aa  126  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4057  hypothetical protein  70.65 
 
 		 96 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4743  hypothetical protein  68.13 
 
 		 101 aa  114  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.369246  normal  0.125381 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003649  hypothetical protein  73.85 
 
 		 69 aa  106  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.13895  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1114  hypothetical protein  69.7 
 
 		 74 aa  103  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0954  hypothetical protein  69.7 
 
 		 74 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1958  hypothetical protein  49.47 
 
 		 104 aa  96.7  9e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.781957  normal  0.865529 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2938  protein of unknown function UPF0153  42.39 
 
 		 134 aa  82.4  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0781616  normal  0.823216 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04095  hypothetical protein  36.36 
 
 		 83 aa  48.1  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1877  hypothetical protein  34.67 
 
 		 224 aa  45.1  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0768  protein of unknown function UPF0153  34.29 
 
 		 198 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.932399 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4386  protein of unknown function UPF0153  34.78 
 
 		 228 aa  43.9  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365173  normal  0.783994 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10181  Fe-S-cluster oxidoreductase  54.84 
 
 		 115 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10191  Fe-S-cluster oxidoreductase  31.88 
 
 		 115 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>