17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3873 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3873  hypothetical protein  100 
 
 		 267 aa  556  1e-157  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.212389 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1490  hypothetical protein  35.56 
 
 		 280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00472854  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2816  hypothetical protein  28.57 
 
 		 280 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.850496  normal  0.117203 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1904  hypothetical protein  32.41 
 
 		 265 aa  94.7  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4795  VTC domain protein  30.53 
 
 		 286 aa  89.4  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2551  hypothetical protein  27.06 
 
 		 282 aa  87  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3226  hypothetical protein  28.87 
 
 		 260 aa  86.3  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3221  hypothetical protein  30.84 
 
 		 281 aa  84  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13050  VTC domain-containing protein  29.32 
 
 		 259 aa  84.3  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1573  VTC domain protein  30.8 
 
 		 294 aa  83.6  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.375137  hitchhiker  0.00558819 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4902  major facilitator superfamily MFS_1  29.38 
 
 		 735 aa  79  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283889  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0852  hypothetical protein  30.8 
 
 		 277 aa  73.6  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.538253  normal  0.0167402 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3117  hypothetical protein  28.9 
 
 		 265 aa  72.4  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0313259  normal  0.140705 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1332  hypothetical protein  28.75 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03050  VTC domain-containing protein  29.24 
 
 		 283 aa  67.4  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3209  hypothetical protein  29.49 
 
 		 268 aa  65.1  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.435311  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2978  hypothetical protein  26.97 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>