50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2869 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_2264  hypothetical protein  62.62 
 
 		 621 aa  689    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.750308  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2869  hypothetical protein  100 
 
 		 568 aa  1169    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.451672  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2694  TPR repeat-containing protein  47.89 
 
 		 580 aa  501  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.407623  normal  0.0520639 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4467  Tetratricopeptide repeat protein  47.16 
 
 		 568 aa  501  1e-140  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2335  Tetratricopeptide domain protein  46.91 
 
 		 563 aa  485  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0014328 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3429  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  47.28 
 
 		 572 aa  477  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2675  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  47.28 
 
 		 572 aa  477  1e-133  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1581  Tetratricopeptide domain protein  47.01 
 
 		 578 aa  476  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00337533  normal  0.487012 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1969  hypothetical protein  44.17 
 
 		 581 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1851  TPR repeat-containing protein  43.98 
 
 		 571 aa  439  9.999999999999999e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1877  hypothetical protein  43.85 
 
 		 587 aa  430  1e-119  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.220347  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0555  tetratricopeptide region  38.83 
 
 		 560 aa  431  1e-119  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.45789  normal  0.384774 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20870  Tetratricopeptide repeat (TPR) protein  41.94 
 
 		 539 aa  399  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1371  TPR repeat-containing protein  39.85 
 
 		 601 aa  384  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0432859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2863  TPR repeat-containing protein  41.21 
 
 		 525 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0105182  normal  0.334378 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0768  TPR repeat-containing protein  35.48 
 
 		 552 aa  351  2e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.400083 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2307  TPR repeat-containing protein  40.86 
 
 		 598 aa  330  3e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.062343 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0989  hypothetical protein  35.84 
 
 		 577 aa  317  3e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.659659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4301  TPR repeat-containing protein  37.92 
 
 		 625 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1004  TPR repeat-containing protein  36.82 
 
 		 625 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3942  TPR repeat-containing protein  35.91 
 
 		 563 aa  300  4e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171262  normal  0.567153 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3291  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.21 
 
 		 625 aa  299  1e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1486  TPR repeat-containing protein  34.12 
 
 		 623 aa  293  8e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3331  TPR repeat-containing protein  34.74 
 
 		 565 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.643296  normal  0.0437808 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1317  TPR repeat-containing protein  35.58 
 
 		 533 aa  270  5.9999999999999995e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.573669  normal  0.99771 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3057  TPR repeat-containing protein  34.48 
 
 		 559 aa  265  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.297776 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2769  tetratricopeptide TPR_2  33.09 
 
 		 563 aa  256  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.156917  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2813  TPR repeat-containing protein  33.09 
 
 		 563 aa  256  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.48594  normal  0.196641 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2796  TPR repeat-containing protein  33.09 
 
 		 563 aa  256  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.489638  normal  0.742166 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03987  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G00240)  31.73 
 
 		 580 aa  252  2e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4326  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.47 
 
 		 584 aa  238  3e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0381  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.91 
 
 		 559 aa  231  3e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.850569  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02878  conserved hypothetical protein  31.56 
 
 		 594 aa  229  7e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.291051 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1465  TPR repeat-containing protein  31.93 
 
 		 574 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.388393  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1379  TPR repeat-containing protein  31.93 
 
 		 559 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2608  TPR domain-containing protein  31.93 
 
 		 601 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1113  TPR repeat-containing protein  31.55 
 
 		 537 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0490058  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0462  TPR domain-containing protein  31.55 
 
 		 537 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0186  TPR domain-containing protein  31.55 
 
 		 537 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.240778  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1219  TPR domain-containing protein  31.55 
 
 		 537 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.121944  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK03470  conserved expressed protein  27.55 
 
 		 576 aa  206  1e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0846142  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02657  conserved hypothetical protein  28.14 
 
 		 600 aa  200  5e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000025246  normal  0.0917143 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38668  predicted protein  31.48 
 
 		 626 aa  172  2e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0793283  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3941  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.82 
 
 		 871 aa  102  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.817968  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2242  TPR repeat-containing protein  29.6 
 
 		 541 aa  97.8  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.433133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5657  tetratricopeptide TPR_4  25.36 
 
 		 530 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3655  TPR repeat-containing protein  30.24 
 
 		 506 aa  94  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1942  tetratricopeptide TPR_4  24.5 
 
 		 530 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1061  tetratricopeptide domain-containing protein  28.91 
 
 		 556 aa  83.6  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2073  TPR repeat-containing protein  31.73 
 
 		 532 aa  83.2  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.378967 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>