8 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2660 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2660  ribosomal protein L31  100 
 
 		 429 aa  881    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.100588  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32920  hypothetical protein  43.36 
 
 		 413 aa  323  4e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1777  hypothetical protein  42.56 
 
 		 423 aa  322  6e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.909044  normal  0.825456 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1393  hypothetical protein  40.1 
 
 		 409 aa  298  1e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.694532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4116  hypothetical protein  37.1 
 
 		 402 aa  278  9e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1302  hypothetical protein  36.64 
 
 		 402 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4586  hypothetical protein  37.34 
 
 		 402 aa  270  5e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.795703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3896  hypothetical protein  37.27 
 
 		 402 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>