11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1967 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1967  hypothetical protein  100 
 
 		 847 aa  1757    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00196238  normal  0.91611 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0332  dead/deah box helicase domain-containing protein  41.54 
 
 		 845 aa  658    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.616588  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1305  DEAD-like helicase  30.57 
 
 		 829 aa  378  1e-103  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0305495  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1147  DEAD-like helicases-like  28.91 
 
 		 859 aa  370  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6719  helicase c2  26.53 
 
 		 840 aa  297  7e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2436  DEAD-like helicase  23.05 
 
 		 834 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1592  helicase c2  26.32 
 
 		 861 aa  175  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3912  DEAD-like helicase  24.76 
 
 		 520 aa  159  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4050  DEAD-like helicase  20.97 
 
 		 857 aa  109  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.429268  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1993  helicase c2  25.56 
 
 		 701 aa  98.6  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.214051  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0920  Hef nuclease  29.2 
 
 		 769 aa  46.2  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>