16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1908 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1908  hypothetical protein  100 
 
 		 321 aa  662    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.110697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2020  S1/P1 nuclease  30.52 
 
 		 287 aa  62  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.304833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0551  S1/P1 nuclease  28.78 
 
 		 285 aa  59.3  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.976409 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00211  putative S1/P1 Nuclease  25.49 
 
 		 268 aa  58.9  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5343  phospholipase C/P1 nuclease domain-containing protein  29.25 
 
 		 312 aa  53.9  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.690717  normal  0.298135 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3221  S1/P1 nuclease  24.69 
 
 		 272 aa  53.9  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0707943  normal  0.405467 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1528  hypothetical protein  42.62 
 
 		 277 aa  52  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1455  hypothetical protein  42.62 
 
 		 279 aa  52.4  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1877  S1/P1 nuclease  34.85 
 
 		 307 aa  50.8  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0607718 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2128  hypothetical protein  34.62 
 
 		 280 aa  50.4  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.491143  normal  0.87042 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0491  S1/P1 nuclease  26.62 
 
 		 253 aa  50.1  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0943322  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0027  hypothetical protein  26.53 
 
 		 301 aa  47.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.512756 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07475  putative S1/P1 Nuclease  25.22 
 
 		 268 aa  48.5  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0413564  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02316  endonuclease  31.86 
 
 		 257 aa  47.8  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2113  S1/P1 nuclease  33.04 
 
 		 299 aa  45.4  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.420885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0543  S1/P1 nuclease  25.81 
 
 		 266 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>