84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1518 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1518  hypothetical protein  100 
 
 		 280 aa  572  1.0000000000000001e-162  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0135842 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1618  hypothetical protein  60.51 
 
 		 277 aa  332  4e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.165792  normal  0.0266154 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2610  hypothetical protein  57.76 
 
 		 277 aa  323  1e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.129841 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2281  hypothetical protein  57.09 
 
 		 277 aa  323  1e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.014395  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2056  hypothetical protein  58.12 
 
 		 279 aa  322  4e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00868426  normal  0.106459 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1645  hypothetical protein  58.7 
 
 		 280 aa  322  4e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.942277  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2481  hypothetical protein  57.97 
 
 		 277 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0367564  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1803  hypothetical protein  57.25 
 
 		 280 aa  318  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.303771  normal  0.460129 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1759  hypothetical protein  57.25 
 
 		 280 aa  318  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2519  hypothetical protein  57.25 
 
 		 280 aa  318  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.830114 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1766  hypothetical protein  57.25 
 
 		 280 aa  318  7e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.530453  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1623  hypothetical protein  56.88 
 
 		 279 aa  317  2e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0568829 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1868  hypothetical protein  56.52 
 
 		 279 aa  317  2e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1697  hypothetical protein  56.88 
 
 		 277 aa  315  4e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1555  hypothetical protein  56.52 
 
 		 279 aa  315  6e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1630  hypothetical protein  56.16 
 
 		 279 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0406608 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1966  hypothetical protein  53.26 
 
 		 276 aa  293  2e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.294395  normal  0.185697 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1452  RNA-binding S1 domain-containing protein  51.81 
 
 		 277 aa  279  4e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1111  hypothetical protein  48.74 
 
 		 298 aa  268  5e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1724  hypothetical protein  45.32 
 
 		 301 aa  258  6e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.437519  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003424  hypothetical protein  46.21 
 
 		 277 aa  258  8e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.303245  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4487  hypothetical protein  48.54 
 
 		 284 aa  258  9e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.830856  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1446  RNA binding S1  46.76 
 
 		 278 aa  252  6e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02354  hypothetical protein  44.4 
 
 		 277 aa  247  2e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1593  hypothetical protein  45.88 
 
 		 278 aa  246  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16900  RNA binding protein, S1 family  47.46 
 
 		 289 aa  245  6e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3786  RNA binding S1  45.52 
 
 		 278 aa  245  6e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.198165  normal  0.0264698 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4023  hypothetical protein  43.68 
 
 		 277 aa  244  8e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2031  RNA-binding S1 domain-containing protein  44.93 
 
 		 277 aa  245  8e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11108  hypothetical protein  43.32 
 
 		 276 aa  244  1.9999999999999999e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.533639  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49930  hypothetical protein  47.48 
 
 		 279 aa  240  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.358542 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4071  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.52 
 
 		 278 aa  239  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1326  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.52 
 
 		 278 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4253  hypothetical protein  47.48 
 
 		 279 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4563  RNA binding S1 domain protein  46.52 
 
 		 278 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3187  GntR family transcriptional regulator  44.8 
 
 		 280 aa  238  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.547241  normal  0.0826379 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5129  RNA binding S1 domain protein  41.88 
 
 		 276 aa  238  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.64066 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1813  hypothetical protein  43.68 
 
 		 277 aa  236  3e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0500461  normal  0.539487 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1515  nucleic acid binding protein  42.96 
 
 		 276 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1514  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.42 
 
 		 279 aa  232  4.0000000000000004e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.493123 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3864  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.05 
 
 		 278 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4021  hypothetical protein  46.57 
 
 		 276 aa  229  4e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000280354  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2783  hypothetical protein  41.34 
 
 		 284 aa  225  6e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0117976  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2080  RNA binding S1 domain protein  44.93 
 
 		 274 aa  224  1e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.56309e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2136  RNA binding S1 domain protein  45.29 
 
 		 274 aa  223  3e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000118125  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1813  hypothetical protein  42.31 
 
 		 283 aa  221  8e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.307669 
 
 
-
 
NC_002950  PG1727  yitL protein  40.73 
 
 		 287 aa  208  6e-53  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2473  RNA binding S1 domain protein  41.88 
 
 		 282 aa  206  5e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.728532 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2579  RNA binding S1 domain protein  40.07 
 
 		 277 aa  199  6e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.401264 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0626  hypothetical protein  38.32 
 
 		 279 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000762305  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1902  hypothetical protein  41.94 
 
 		 280 aa  192  5e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000000109992  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2647  hypothetical protein  40.58 
 
 		 274 aa  192  7e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.902029  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0056  RNA binding S1  45.66 
 
 		 301 aa  190  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1621  hypothetical protein  41.22 
 
 		 280 aa  189  5.999999999999999e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000222991  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3240  uncharacterized protein-like protein  41.07 
 
 		 280 aa  187  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0235  hypothetical protein  40.88 
 
 		 295 aa  180  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000105707  hitchhiker  0.0000000000000116702 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2903  RNA binding S1 domain protein  34.05 
 
 		 278 aa  168  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.144767  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0250  RNA-binding S1 domain-containing protein  34.52 
 
 		 279 aa  166  2.9999999999999998e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000115612  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01079  hypothetical protein  34.01 
 
 		 305 aa  160  3e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0312  hypothetical protein  31.09 
 
 		 282 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1062  RNA-binding S1 domain-containing protein  29.43 
 
 		 284 aa  100  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0425998  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1214  hypothetical protein  29.89 
 
 		 284 aa  99.8  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4127  hypothetical protein  29.54 
 
 		 284 aa  99  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.098552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1319  hypothetical protein  29.54 
 
 		 284 aa  99  8e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.270285  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1274  hypothetical protein  29.54 
 
 		 284 aa  99  8e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.51389  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0712  RNA binding S1 domain protein  28.83 
 
 		 286 aa  98.2  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000721227  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1082  hypothetical protein  29.18 
 
 		 284 aa  97.1  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1241  hypothetical protein  29.18 
 
 		 284 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1065  hypothetical protein  29.18 
 
 		 284 aa  97.1  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1167  hypothetical protein  29.18 
 
 		 284 aa  97.1  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1060  hypothetical protein  29.18 
 
 		 284 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0877  RNA-binding S1 domain-containing protein  26.16 
 
 		 284 aa  93.2  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1187  hypothetical protein  37.68 
 
 		 151 aa  87.4  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0886  RNA binding S1 domain protein  26.29 
 
 		 274 aa  86.3  5e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000369657  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1481  hypothetical protein  31.37 
 
 		 300 aa  81.3  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1452  hypothetical protein  31.37 
 
 		 300 aa  81.3  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.288819  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1511  hypothetical protein  28.74 
 
 		 284 aa  78.2  0.0000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00830658  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0476  RNA-binding protein  28.23 
 
 		 299 aa  77.4  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0883  RNA-binding protein  27.62 
 
 		 297 aa  78.2  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000841553 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2289  RNA-binding protein  28.77 
 
 		 285 aa  77  0.0000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1301  RNA-binding protein  27.13 
 
 		 287 aa  74.7  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.237432  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0961  hypothetical protein  27.27 
 
 		 298 aa  69.7  0.00000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.93034  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0752  hypothetical protein  25.84 
 
 		 293 aa  65.5  0.0000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000115591  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42428  predicted protein  34.95 
 
 		 252 aa  52  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>