13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0265 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0265  hypothetical protein  100 
 
 		 55 aa  110  6e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0107016 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2672  hypothetical protein  51.02 
 
 		 64 aa  52.8  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2740  hypothetical protein  51.02 
 
 		 64 aa  52.8  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2847  hypothetical protein  51.02 
 
 		 64 aa  52.8  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001939  hypothetical protein  56.36 
 
 		 65 aa  52.8  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3711  hypothetical protein  55.32 
 
 		 64 aa  49.7  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3999  hypothetical protein  53.06 
 
 		 64 aa  48.9  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3048  hypothetical protein  47.06 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4136  hypothetical protein  56.25 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.208724  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1578  hypothetical protein  48 
 
 		 63 aa  48.1  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2499  hypothetical protein  53.49 
 
 		 74 aa  45.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3025  hypothetical protein  45 
 
 		 94 aa  41.6  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01266  hypothetical protein  53.06 
 
 		 64 aa  40.4  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.204518  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>