27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_2497 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2497  hypothetical protein  100 
 
 
124 aa  242  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.404496  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1825  hypothetical protein  100 
 
 
124 aa  242  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0194222  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1788  hypothetical protein  100 
 
 
124 aa  242  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.722398  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1781  hypothetical protein  99.19 
 
 
124 aa  238  2e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0111743  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2872  hypothetical protein  86.29 
 
 
124 aa  195  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1693  hypothetical protein  84.68 
 
 
140 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.337002  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1645  hypothetical protein  72.95 
 
 
142 aa  185  2e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1753  hypothetical protein  73.39 
 
 
125 aa  180  6e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.819388  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2167  hypothetical protein  72.36 
 
 
123 aa  176  7e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1839  hypothetical protein  65.85 
 
 
123 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124556  normal  0.17507 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1647  hypothetical protein  84.68 
 
 
126 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2421  hypothetical protein  83.87 
 
 
126 aa  170  6.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0112375  hitchhiker  0.000913176 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2349  hypothetical protein  83.87 
 
 
126 aa  169  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0136957  decreased coverage  0.000000000361738 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2439  hypothetical protein  70.73 
 
 
123 aa  163  8e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00685345 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1969  hypothetical protein  69.67 
 
 
123 aa  155  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00366875  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1915  hypothetical protein  60.32 
 
 
130 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.130481  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3192  hypothetical protein  37.17 
 
 
131 aa  87  7e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0660225  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1747  hypothetical protein  54.88 
 
 
145 aa  87  7e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1072  hypothetical protein  38.14 
 
 
129 aa  84.7  4e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.105151  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02145  hypothetical protein  37.5 
 
 
140 aa  79.7  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0123559  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2386  hypothetical protein  49.28 
 
 
146 aa  73.9  0.0000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2486  hypothetical protein  40.98 
 
 
142 aa  71.6  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002785  hypothetical protein  48.24 
 
 
146 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03196  hypothetical protein  47.06 
 
 
127 aa  70.1  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1669  membrane protein-like protein  34.25 
 
 
135 aa  46.2  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0706  putative transmembrane protein  25.6 
 
 
125 aa  40.8  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.445384  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1829  membrane protein-like  33.33 
 
 
134 aa  40.4  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0269276 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>