12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_0751 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0751  hypothetical protein  100 
 
 
45 aa  94.4  5e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.852323  hitchhiker  0.0026184 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1960  GP46  88.89 
 
 
115 aa  88.2  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0499006  normal  0.0379275 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2002  GP46  88.89 
 
 
115 aa  87.8  5e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00138731  normal  0.6792 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0758  GP46  88.89 
 
 
106 aa  87  8e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00217936  unclonable  0.00000966346 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3507  GP46  86.67 
 
 
106 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0774755  hitchhiker  0.00450512 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1845  GP46  86.67 
 
 
106 aa  85.5  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00167765  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0728  GP46  84.44 
 
 
106 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00505701  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1953  GP46  84.44 
 
 
115 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000678855  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3271  GP46  84.44 
 
 
106 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183285  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3408  GP46  84.44 
 
 
106 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0559716  hitchhiker  0.000734807 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2575  GP46  82.22 
 
 
110 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.029841  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3382  GP46  84.44 
 
 
106 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000163706  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>