13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E0692 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E0692  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  287  4e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000916381  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2285  protein of unknown function DUF1019  96.43 
 
 		 140 aa  282  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180107  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1432  hypothetical protein  29.86 
 
 		 141 aa  53.5  0.0000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000253642  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2277  hypothetical protein  29.86 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000286222  hitchhiker  0.0000000000000109213 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1258  hypothetical protein  30.56 
 
 		 141 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000158089  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2809  hypothetical protein  30.56 
 
 		 141 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.543438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3235  hypothetical protein  35.42 
 
 		 179 aa  50.1  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.338161  hitchhiker  0.000443266 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1509  hypothetical protein  29.86 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.633162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2251  hypothetical protein  40 
 
 		 158 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000346124  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0809  hypothetical protein  33.33 
 
 		 179 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.507484  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2246  hypothetical protein  33.33 
 
 		 154 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000552786  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1137  hypothetical protein  43.86 
 
 		 115 aa  40.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000105893  hitchhiker  3.11479e-26 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1150  hypothetical protein  28.24 
 
 		 132 aa  40.4  0.009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.59138  normal  0.272741 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>