21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E0603 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E0603  hypothetical protein  100 
 
 		 37 aa  77  0.00000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00614  hypothetical protein  94.59 
 
 		 235 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00603  hypothetical protein  94.59 
 
 		 235 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0735  hypothetical protein  94.59 
 
 		 235 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.622505 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0666  hypothetical protein  94.59 
 
 		 235 aa  74.3  0.0000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.40885  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2981  protein of unknown function DUF1266  91.89 
 
 		 235 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0673  hypothetical protein  91.89 
 
 		 235 aa  72  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.143249  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3000  hypothetical protein  91.89 
 
 		 235 aa  71.6  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0676  hypothetical protein  59.46 
 
 		 235 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0738  hypothetical protein  59.46 
 
 		 235 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.691398 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0669  hypothetical protein  59.46 
 
 		 235 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0714  putative cytoplasmic protein  54.05 
 
 		 231 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.347857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0774  hypothetical protein  54.05 
 
 		 231 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0761  hypothetical protein  54.05 
 
 		 231 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.538719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0700  putative cytoplasmic protein  54.05 
 
 		 231 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.178652  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2978  protein of unknown function DUF1266  56.76 
 
 		 235 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2997  hypothetical protein  56.76 
 
 		 235 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0759  hypothetical protein  48.65 
 
 		 204 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0698  putative cytoplasmic protein  48.65 
 
 		 204 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0344011  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0772  hypothetical protein  48.65 
 
 		 204 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0712  putative cytoplasmic protein  48.65 
 
 		 204 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.379869  normal  0.995963 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>