49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_1250 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_1275  RNA-binding S4 domain-containing protein  100 
 
 
268 aa  554  1e-157  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000253973  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1250  RNA-binding S4 domain-containing protein  100 
 
 
268 aa  554  1e-157  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000129333  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0756  ylmH protein  70.91 
 
 
220 aa  333  3e-90  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.031626  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1037  RNA-binding S4 domain protein  42.63 
 
 
257 aa  223  2e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000298489  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1907  RNA-binding S4 domain protein  41.53 
 
 
257 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2546  RNA-binding S4 domain-containing protein  40.62 
 
 
257 aa  207  1e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0803565  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1243  S4 domain protein  41.8 
 
 
255 aa  198  6e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000893019  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3724  RNA-binding S4 domain-containing protein  41.02 
 
 
255 aa  193  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0195579  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3656  S4 domain-containing protein  40.62 
 
 
255 aa  191  8e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3911  S4 domain protein  41.02 
 
 
255 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000445845 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3639  S4 domain-containing protein  40.23 
 
 
255 aa  189  4e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000680133  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3949  S4 domain protein  40.62 
 
 
255 aa  188  8e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000108737  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3748  S4 domain-containing protein  40.23 
 
 
255 aa  187  1e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.125171  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4036  s4 domain-containing protein  40.23 
 
 
255 aa  187  1e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00128697  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3942  S4 domain-containing protein  40.62 
 
 
255 aa  186  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131052  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0596  RNA-binding S4 domain-containing protein  41.43 
 
 
261 aa  187  2e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000430784  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3998  S4 domain protein  42.06 
 
 
241 aa  186  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000894164  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1489  cell division protein  37.5 
 
 
265 aa  164  2.0000000000000002e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2058  cell division protein  37.45 
 
 
263 aa  161  1e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0781  cell division protein  33.33 
 
 
266 aa  152  5e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0824201  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0483  ylmH protein  36 
 
 
262 aa  150  2e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1198  cell division protein  36.4 
 
 
265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1318  RNA-binding S4 domain protein  30.08 
 
 
265 aa  124  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.210837  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0715  RNA-binding S4 domain-containing protein  30.49 
 
 
255 aa  122  5e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.369549  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1889  RNA-binding S4 domain-containing protein  32.27 
 
 
248 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000373186  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1140  cell division protein  30.4 
 
 
256 aa  112  5e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09250  RNA-binding S4 domain protein  29.03 
 
 
262 aa  112  9e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0028436  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1086  RNA-binding S4 domain protein  30.61 
 
 
267 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000637661  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5081  photosystem II S4 domain-containing protein  31.95 
 
 
259 aa  102  5e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.673535  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0789  RNA-binding S4  31.05 
 
 
263 aa  102  7e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000446217  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4198  RNA-binding S4  29.75 
 
 
259 aa  101  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113928  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1012  RNA-binding S4  29.92 
 
 
259 aa  97.8  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00865709 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0920  RNA-binding S4 domain protein  27.23 
 
 
255 aa  97.8  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000818747  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1503  RNA-binding S4  27.85 
 
 
259 aa  93.2  4e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.2704  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4774  photosystem II S4 domain protein  29.63 
 
 
259 aa  92  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.789019 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2321  photosystem II S4 domain protein  28.4 
 
 
259 aa  92  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1296  hypothetical protein  28.51 
 
 
255 aa  90.5  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4044  RNA-binding S4 domain protein  28.63 
 
 
265 aa  90.1  4e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000223229  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2360  RNA-binding S4 domain-containing protein  29.52 
 
 
263 aa  87.8  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000894269  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0599  RNA-binding S4 domain protein  28.57 
 
 
260 aa  86.3  5e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000013354  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41009  predicted protein  25.41 
 
 
303 aa  84.3  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.106009  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1264  RNA-binding S4 domain protein  30.22 
 
 
245 aa  82.8  0.000000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3250  photosystem II S4 domain protein  25.93 
 
 
259 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2846  photosystem II S4 domain protein  25.93 
 
 
259 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2106  S4 domain-containing protein  26.13 
 
 
253 aa  72.4  0.000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00816123  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1087  RNA-binding S4 domain protein  27.63 
 
 
255 aa  72.4  0.000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1347  RNA-binding S4 domain protein  25.99 
 
 
260 aa  71.6  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000348222  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1820  S4 domain-containing protein  25.63 
 
 
253 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000243371  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2152  RNA-binding S4  21.67 
 
 
258 aa  44.3  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.224826  normal  0.370435 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>