24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2690 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_2690  hypothetical protein  100 
 
 
498 aa  1011    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2711  hypothetical protein  54.47 
 
 
474 aa  518  1.0000000000000001e-145  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0676  hypothetical protein  55.81 
 
 
454 aa  511  1e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.780487 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2788  hypothetical protein  36.9 
 
 
484 aa  294  3e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1514  hypothetical protein  35.37 
 
 
476 aa  281  1e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.721483  normal  0.922529 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2733  hypothetical protein  33.81 
 
 
478 aa  270  4e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3318  hypothetical protein  34.59 
 
 
467 aa  254  3e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0973  hypothetical protein  34.01 
 
 
485 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.442051  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0138  hypothetical protein  33.4 
 
 
469 aa  244  3e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000720067  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1912  hypothetical protein  31.16 
 
 
484 aa  226  7e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000398652  normal  0.171449 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1763  hypothetical protein  31.65 
 
 
501 aa  224  3e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1929  hypothetical protein  28.57 
 
 
510 aa  217  5e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.696713  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3680  hypothetical protein  25.84 
 
 
506 aa  172  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.477628 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0011  hypothetical protein  30.23 
 
 
493 aa  145  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.578419 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2583  hypothetical protein  27.16 
 
 
463 aa  119  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0198931 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2710  hypothetical protein  27.06 
 
 
519 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.305499 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0677  hypothetical protein  33.62 
 
 
524 aa  116  7.999999999999999e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.823751 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2689  hypothetical protein  26.55 
 
 
506 aa  115  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1062  hypothetical protein  24.81 
 
 
460 aa  71.2  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0471  hypothetical protein  21.91 
 
 
373 aa  62.8  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1339  hypothetical protein  24.51 
 
 
432 aa  49.3  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1017  hypothetical protein  27.52 
 
 
392 aa  47  0.0008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1148  hypothetical protein  27.64 
 
 
408 aa  46.6  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.159501 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1113  hypothetical protein  36.25 
 
 
392 aa  45.8  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>