126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0883 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0883  arginine succinyltransferase  100 
 
 
345 aa  706    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.174815  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1940  arginine N-succinyltransferase  67.74 
 
 
330 aa  459  9.999999999999999e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0526  arginine succinyltransferase  43.57 
 
 
357 aa  273  5.000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.187966  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0656  arginine N-succinyltransferase  39.35 
 
 
339 aa  256  6e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.868394  hitchhiker  0.0000048698 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3298  arginine N-succinyltransferase  39.35 
 
 
339 aa  252  6e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1969  arginine succinyltransferase  41.47 
 
 
344 aa  249  3e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0810  arginine N-succinyltransferase  38.76 
 
 
339 aa  249  4e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00028495 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3418  arginine succinyltransferase  39.64 
 
 
339 aa  249  6e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0994163 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3515  arginine N-succinyltransferase  38.76 
 
 
339 aa  249  7e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2122  arginine N-succinyltransferase  40.18 
 
 
348 aa  249  7e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.653543  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01716  arginine succinyltransferase  41.18 
 
 
344 aa  248  9e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1895  arginine N-succinyltransferase  41.18 
 
 
344 aa  248  9e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.564615  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01704  hypothetical protein  41.18 
 
 
344 aa  248  9e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2465  arginine succinyltransferase  41.18 
 
 
344 aa  248  9e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1830  arginine succinyltransferase  41.18 
 
 
344 aa  248  9e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1885  arginine succinyltransferase  41.18 
 
 
344 aa  248  9e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0106586 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1444  arginine succinyltransferase  41.18 
 
 
344 aa  248  9e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.606563 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0612  arginine succinyltransferase  39.64 
 
 
339 aa  248  1e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0611  arginine succinyltransferase  39.64 
 
 
339 aa  248  1e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0978523 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4293  arginine succinyltransferase  39.88 
 
 
343 aa  248  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.920553 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1159  arginine N-succinyltransferase  39.88 
 
 
343 aa  247  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.26404  normal  0.0654026 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1063  arginine N-succinyltransferase  41.06 
 
 
347 aa  248  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0114093  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1857  arginine succinyltransferase  41.69 
 
 
338 aa  247  2e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0210097  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0703  arginine N-succinyltransferase  39.88 
 
 
343 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1182  arginine N-succinyltransferase  39.88 
 
 
343 aa  247  3e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.187182  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1697  arginine succinyltransferase  42.06 
 
 
344 aa  246  4e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1994  arginine succinyltransferase  40.88 
 
 
344 aa  246  4e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0635  arginine N-succinyltransferase  37.5 
 
 
338 aa  246  4.9999999999999997e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0646  arginine N-succinyltransferase  38.76 
 
 
339 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3753  arginine N-succinyltransferase  38.76 
 
 
339 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3879  arginine N-succinyltransferase  38.76 
 
 
339 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1063  arginine N-succinyltransferase  40.64 
 
 
348 aa  246  6e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3696  arginine N-succinyltransferase  38.76 
 
 
339 aa  245  8e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3010  arginine N-succinyltransferase  39.35 
 
 
339 aa  245  8e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0572  arginine N-succinyltransferase  38.46 
 
 
339 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52690  arginine/ornithine succinyltransferase AII subunit  41.89 
 
 
340 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.433336  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1399  arginine succinyltransferase  41.18 
 
 
344 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.121302 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1869  arginine succinyltransferase  41.18 
 
 
344 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3669  arginine N-succinyltransferase  39.81 
 
 
350 aa  243  3.9999999999999997e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.386578  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1416  arginine succinyltransferase  41.18 
 
 
344 aa  242  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2042  arginine succinyltransferase  41.18 
 
 
344 aa  242  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0825718  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1431  arginine succinyltransferase  41.18 
 
 
344 aa  242  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.899315  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3192  arginine N-succinyltransferase  37.87 
 
 
339 aa  241  2e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0337373  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1777  arginine N-succinyltransferase beta subunit  38.99 
 
 
343 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2202  arginine/ornithine succinyltransferase subunit  41.37 
 
 
334 aa  240  2.9999999999999997e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.276454 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0618  arginine N-succinyltransferase  38.46 
 
 
339 aa  239  5e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2921  arginine succinyltransferase  38.99 
 
 
343 aa  239  5e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.651402  normal  0.342556 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1560  arginine N-succinyltransferase  39.41 
 
 
346 aa  239  5e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.551289  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1055  arginine N-succinyltransferase  36.15 
 
 
347 aa  239  5e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4618  arginine/ornithine succinyltransferase AII subunit  41.3 
 
 
340 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311562  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2845  arginine N-succinyltransferase beta subunit  38.99 
 
 
343 aa  238  8e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2725  arginine N-succinyltransferase, beta subunit  38.99 
 
 
343 aa  238  9e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0650  arginine N-succinyltransferase  36.95 
 
 
344 aa  238  2e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2783  arginine N-succinyltransferase, beta subunit  38.69 
 
 
343 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.472941  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0579  arginine N-succinyltransferase  37.28 
 
 
339 aa  237  2e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.934676 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0593  arginine N-succinyltransferase, beta chain  38.69 
 
 
343 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1665  arginine N-succinyltransferase, beta chain  35.61 
 
 
347 aa  236  5.0000000000000005e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2423  arginine N-succinyltransferase, beta subunit  38.69 
 
 
343 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.441325  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2868  arginine N-succinyltransferase, beta subunit  38.69 
 
 
343 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1734  arginine N-succinyltransferase, beta subunit  38.69 
 
 
343 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.559674  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1671  arginine N-succinyltransferase, beta chain  35.31 
 
 
346 aa  235  1.0000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2806  arginine succinyltransferase  41.59 
 
 
338 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0528  arginine succinyltransferase  40.18 
 
 
334 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.556495  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2843  arginine succinyltransferase  39.76 
 
 
344 aa  233  3e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.836294  hitchhiker  0.00555507 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1627  arginine N-succinyltransferase  36.15 
 
 
348 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.299273 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3317  arginine N-succinyltransferase  36.76 
 
 
361 aa  231  1e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2120  arginine succinyltransferase  37.97 
 
 
349 aa  231  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2228  arginine succinyltransferase  38.11 
 
 
350 aa  231  1e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0164  arginine N-succinyltransferase  36.42 
 
 
346 aa  230  2e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.468749  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2519  arginine succinyltransferase  38.11 
 
 
350 aa  230  3e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2909  arginine succinyltransferase  39.35 
 
 
338 aa  229  5e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.633986 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0485  arginine succinyltransferase  38.69 
 
 
344 aa  226  4e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.468224  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3563  arginine N-succinyltransferase  39.82 
 
 
341 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.179201  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4283  arginine succinyltransferase  39.88 
 
 
341 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.795056  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1834  arginine N-succinyltransferase, beta subunit  39.53 
 
 
341 aa  226  6e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.860406  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1785  arginine N-succinyltransferase  38.69 
 
 
341 aa  218  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00498  arginine N-succinyltransferase  38.24 
 
 
345 aa  217  2e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2194  putative arginine/ornithine succinyltransferase  35.42 
 
 
339 aa  218  2e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34480  arginine N-succinyltransferase  39.12 
 
 
345 aa  215  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3768  arginine N-succinyltransferase  39.41 
 
 
342 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.243261  normal  0.0192708 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4480  arginine N-succinyltransferase, alpha subunit  36.99 
 
 
339 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.98058  normal  0.247147 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1435  arginine N-succinyltransferase  36.99 
 
 
339 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.888596  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3668  arginine N-succinyltransferase  35.36 
 
 
337 aa  211  2e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0458765  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1776  arginine N-succinyltransferase, alpha chain  34.81 
 
 
352 aa  210  3e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3769  arginine/ornithine succinyltransferase, alpha subunit  36.42 
 
 
339 aa  210  4e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0115 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3985  arginine/ornithine succinyltransferase, alpha subunit  36.71 
 
 
339 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4479  arginine N-succinyltransferase, beta subunit  39.41 
 
 
342 aa  209  6e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.198516  normal  0.241866 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1436  arginine N-succinyltransferase  39.41 
 
 
342 aa  209  6e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2846  arginine N-succinyltransferase beta subunit  35.88 
 
 
352 aa  206  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2726  arginine N-succinyltransferase, alpha subunit  35.88 
 
 
352 aa  206  4e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2784  arginine N-succinyltransferase, alpha subunit  35.88 
 
 
352 aa  206  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3984  arginine N-succinyltransferase  38.82 
 
 
342 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1559  arginine/ornithine succinyltransferase, alpha subunit  34.12 
 
 
352 aa  206  5e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.758428  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2734  arginine N-succinyltransferase  36.29 
 
 
339 aa  206  6e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0592  arginine N-succinyltransferase, alpha chain  35.69 
 
 
346 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2424  arginine N-succinyltransferase, alpha chain  35.69 
 
 
346 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.1511  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2867  arginine N-succinyltransferase, alpha chain  35.69 
 
 
346 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1735  arginine N-succinyltransferase, alpha chain  35.69 
 
 
346 aa  205  1e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.680184  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52700  arginine/ornithine succinyltransferase AI subunit  35.55 
 
 
338 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.6133  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3318  arginine N-succinyltransferase  35.78 
 
 
338 aa  204  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>