24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3962 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3962  hypothetical protein  100 
 
 		 194 aa  392  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0478581  normal  0.244744 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3582  hypothetical protein  87.63 
 
 		 194 aa  348  3e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1798  hypothetical protein  52.78 
 
 		 194 aa  188  2.9999999999999997e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6481  hypothetical protein  51.72 
 
 		 299 aa  182  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.459745  normal  0.157533 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0331  hypothetical protein  48.88 
 
 		 366 aa  173  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0889  hypothetical protein  46.24 
 
 		 272 aa  167  6e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0809  hypothetical protein  47.06 
 
 		 189 aa  164  8e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.184742  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0571  hypothetical protein  46.86 
 
 		 191 aa  164  9e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16870  hypothetical protein  47.12 
 
 		 200 aa  159  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.541123  normal  0.250985 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7897  hypothetical protein  44.57 
 
 		 198 aa  155  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2738  hypothetical protein  41.8 
 
 		 198 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2833  hypothetical protein  45.25 
 
 		 231 aa  145  5e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.281576  decreased coverage  0.00256683 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0989  hypothetical protein  42.78 
 
 		 183 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0979  hypothetical protein  41.67 
 
 		 183 aa  134  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.128032  normal  0.0985074 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0961  hypothetical protein  41.67 
 
 		 183 aa  134  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.193849  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4387  hypothetical protein  37.57 
 
 		 185 aa  122  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1190  hypothetical protein  28.14 
 
 		 264 aa  57  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2864  hypothetical protein  29.21 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.197887  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1652  hypothetical protein  25.86 
 
 		 278 aa  50.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4055  hypothetical protein  30.07 
 
 		 271 aa  47  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.851033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2769  hypothetical protein  26.35 
 
 		 267 aa  46.6  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1702  hypothetical protein  27.71 
 
 		 270 aa  43.9  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0196867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0483  hypothetical protein  29.79 
 
 		 272 aa  44.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0142  hypothetical protein  26.22 
 
 		 286 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>