19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2344 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2344  hypothetical protein  100 
 
 
160 aa  321  3e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.612858  normal  0.355354 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2173  hypothetical protein  75.62 
 
 
161 aa  251  3e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.294686  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0511  hypothetical protein  66.91 
 
 
141 aa  195  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.852458 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4098  hypothetical protein  55.62 
 
 
160 aa  163  8e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.369529  normal  0.550051 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8844  hypothetical protein  51.72 
 
 
146 aa  152  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.231171 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0788  hypothetical protein  53.9 
 
 
180 aa  152  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.571735  normal  0.0340208 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2079  Domain of unknown function DUF1801  54.86 
 
 
150 aa  150  5e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0297995  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1178  hypothetical protein  54.89 
 
 
128 aa  139  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2394  hypothetical protein  51.77 
 
 
157 aa  138  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000734889  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0555  hypothetical protein  45.86 
 
 
156 aa  135  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3434  hypothetical protein  47.89 
 
 
156 aa  134  6.0000000000000005e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0744496  normal  0.059661 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1024  Domain of unknown function DUF1801  48.23 
 
 
152 aa  131  3.9999999999999996e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.187798  normal  0.287584 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2642  hypothetical protein  43.36 
 
 
146 aa  122  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3371  hypothetical protein  48.59 
 
 
161 aa  116  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168158  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1217  hypothetical protein  46.55 
 
 
153 aa  103  9e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.889377  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19540  protein of unknown function (DU1801)  33.05 
 
 
132 aa  70.5  0.000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.275996  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3419  hypothetical protein  30.33 
 
 
120 aa  59.7  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2458  Domain of unknown function DUF1801  47.06 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0934396  hitchhiker  0.00000261825 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22220  protein of unknown function (DU1801)  32.41 
 
 
99 aa  50.1  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>