13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2330 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2330  VioB - polyketide synthase  100 
 
 		 1069 aa  2172    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0866221  hitchhiker  0.0021675 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6674  hypothetical protein  25.62 
 
 		 508 aa  67  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.407943  normal  0.68349 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5171  hypothetical protein  29.71 
 
 		 594 aa  66.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0902166  hitchhiker  0.00324172 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5987  hypothetical protein  24.37 
 
 		 370 aa  62.8  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.373978 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4490  hypothetical protein  31.34 
 
 		 506 aa  60.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0688012 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0631  hypothetical protein  27.69 
 
 		 343 aa  56.6  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.107314  normal  0.14851 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2098  hypothetical protein  26.87 
 
 		 351 aa  55.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.217218  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2097  hypothetical protein  24.15 
 
 		 518 aa  54.7  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.92303  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1877  hypothetical protein  24.46 
 
 		 519 aa  54.7  0.000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0289  hypothetical protein  22.64 
 
 		 409 aa  53.9  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.929671  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1595  hypothetical protein  25.27 
 
 		 413 aa  53.5  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.474795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4187  hypothetical protein  24.16 
 
 		 366 aa  51.6  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.637966  hitchhiker  0.00122785 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2509  hypothetical protein  26.13 
 
 		 367 aa  47  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.607517  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>