22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2265 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2265  hypothetical protein  100 
 
 
136 aa  261  3e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.210713  normal  0.0751956 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2121  hypothetical protein  86.76 
 
 
196 aa  226  9e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.277797  normal  0.0126504 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9020  hypothetical protein  44.35 
 
 
124 aa  89  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3998  hypothetical protein  46.46 
 
 
137 aa  71.6  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4770  hypothetical protein  33.33 
 
 
125 aa  69.7  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.444502  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1455  hypothetical protein  38.28 
 
 
133 aa  69.3  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0296741  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4495  hypothetical protein  33.87 
 
 
133 aa  67.4  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3823  Protein of unknown function DUF2267  35.2 
 
 
131 aa  64.3  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2270  hypothetical protein  38.58 
 
 
133 aa  62.8  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000078437  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0721  hypothetical protein  38.33 
 
 
127 aa  61.6  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0171189  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3361  hypothetical protein  37.19 
 
 
121 aa  61.2  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9245  hypothetical protein  38.58 
 
 
268 aa  60.5  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0648  Protein of unknown function DUF2267  37.31 
 
 
136 aa  59.7  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.270306  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07750  hypothetical protein  37.5 
 
 
136 aa  58.9  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7349  hypothetical protein  36.84 
 
 
259 aa  56.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3703  Protein of unknown function DUF2267  36.45 
 
 
138 aa  54.3  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1294  hypothetical protein  28.36 
 
 
145 aa  46.6  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0137379  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3772  Protein of unknown function DUF2267  29.55 
 
 
172 aa  46.2  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2011  CBS domain-containing protein  33 
 
 
286 aa  45.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0342  hypothetical protein  27.64 
 
 
146 aa  44.3  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.881647 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3765  hypothetical protein  33.33 
 
 
146 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13970  hypothetical protein  27.72 
 
 
211 aa  40.4  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.607556 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>