21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1742 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_1742  hypothetical protein  100 
 
 
137 aa  275  1e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.198279  hitchhiker  0.00269492 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1756  hypothetical protein  90.3 
 
 
134 aa  249  9.000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.721453  normal  0.723932 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14450  hypothetical protein  64.12 
 
 
136 aa  167  5e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.408221  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2742  ChaB family protein  64.39 
 
 
131 aa  164  4e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.764397  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3652  ChaB  61.72 
 
 
139 aa  159  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3725  ChaB family protein  61.72 
 
 
139 aa  159  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.794825 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0793  ChaB family protein  60.94 
 
 
139 aa  155  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3411  hypothetical protein  62.31 
 
 
141 aa  154  4e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3665  ChaB family protein  60.16 
 
 
139 aa  153  8e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.764782  normal  0.692759 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4587  ChaB family protein  59.26 
 
 
138 aa  152  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0893  hypothetical protein  60.45 
 
 
134 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1804  hypothetical protein  60.83 
 
 
133 aa  151  2.9999999999999998e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5498  hypothetical protein  62.81 
 
 
130 aa  150  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00390859  normal  0.0589303 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0871  ChaB family protein  55.47 
 
 
140 aa  143  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4490  ChaB family protein  61.72 
 
 
134 aa  141  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0526847 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02480  ChaB protein  55.12 
 
 
141 aa  138  1.9999999999999998e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1538  hypothetical protein  63.85 
 
 
153 aa  139  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.213562  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2019  ChaB family protein  54.68 
 
 
142 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000742631  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3007  ChaB family protein  56.59 
 
 
141 aa  133  6.0000000000000005e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000471912  hitchhiker  0.000140663 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0646  hypothetical protein  57.89 
 
 
97 aa  48.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.212732  normal  0.49792 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23330  hypothetical protein  68.97 
 
 
99 aa  43.9  0.0007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>