21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2711 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2711  hypothetical protein  100 
 
 		 474 aa  956    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.522315 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0676  hypothetical protein  63.29 
 
 		 454 aa  563  1.0000000000000001e-159  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.780487 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2690  hypothetical protein  55.28 
 
 		 498 aa  513  1e-144  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2788  hypothetical protein  35.85 
 
 		 484 aa  286  5e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1514  hypothetical protein  35.93 
 
 		 476 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.721483  normal  0.922529 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0973  hypothetical protein  35.97 
 
 		 485 aa  263  6e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.442051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2733  hypothetical protein  34.32 
 
 		 478 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3318  hypothetical protein  34.86 
 
 		 467 aa  231  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0138  hypothetical protein  34.65 
 
 		 469 aa  231  3e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000720067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1912  hypothetical protein  31.86 
 
 		 484 aa  229  7e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000398652  normal  0.171449 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1763  hypothetical protein  31.03 
 
 		 501 aa  215  9.999999999999999e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1929  hypothetical protein  31.75 
 
 		 510 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.696713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3680  hypothetical protein  30.63 
 
 		 506 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.477628 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0011  hypothetical protein  28.33 
 
 		 493 aa  167  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.578419 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0677  hypothetical protein  28.09 
 
 		 524 aa  147  6e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.823751 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2710  hypothetical protein  28.16 
 
 		 519 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.305499 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2689  hypothetical protein  28.57 
 
 		 506 aa  119  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2583  hypothetical protein  25.39 
 
 		 463 aa  118  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0198931 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1062  hypothetical protein  24.03 
 
 		 460 aa  86.7  9e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0471  hypothetical protein  20.83 
 
 		 373 aa  61.2  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1339  hypothetical protein  23.84 
 
 		 432 aa  55.8  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>