17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2534 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2534  hypothetical protein  100 
 
 		 220 aa  447  1e-125  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2603  hypothetical protein  30.33 
 
 		 219 aa  92.4  5e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5192  hypothetical protein  29.46 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.461335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1985  hypothetical protein  29.09 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2068  hypothetical protein  27.04 
 
 		 236 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0161763  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1903  hypothetical protein  27.04 
 
 		 236 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0845396  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1916  hypothetical protein  27.04 
 
 		 236 aa  50.8  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1027  hypothetical protein  30.23 
 
 		 154 aa  49.3  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.484746  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0853  hypothetical protein  26.61 
 
 		 236 aa  48.9  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1201  hypothetical protein  26.61 
 
 		 236 aa  48.9  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.123742  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0307  hypothetical protein  26.61 
 
 		 236 aa  48.9  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.630758  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1645  hypothetical protein  26.61 
 
 		 236 aa  48.9  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.682807  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2240  hypothetical protein  26.99 
 
 		 225 aa  48.9  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2052  hypothetical protein  27.43 
 
 		 233 aa  47.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.55944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1426  hypothetical protein  33.33 
 
 		 231 aa  45.1  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1356  hypothetical protein  36.51 
 
 		 154 aa  41.6  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3383  hypothetical protein  25.71 
 
 		 157 aa  41.6  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.20248  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>