28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2012 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2012  hypothetical protein  100 
 
 		 229 aa  461  1e-129  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.581961  normal  0.0111404 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0589  hypothetical protein  52.65 
 
 		 232 aa  218  5e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.29516  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2339  hypothetical protein  46.9 
 
 		 217 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.039929  normal  0.763516 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2442  lipoprotein transmembrane  29.78 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2878  hypothetical protein  29.28 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3114  hypothetical protein  40.96 
 
 		 249 aa  58.2  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.459688 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0465  putative lipoprotein  27.66 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0709301  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2921  putative lipoprotein  28.69 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.959785  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0984  putative lipoprotein  27.66 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2612  putative lipoprotein  27.66 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0163  putative lipoprotein  27.66 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.447071  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0924  putative transmembrane lipoprotein  26.34 
 
 		 234 aa  55.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.132488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3027  putative lipoprotein  27.66 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0877  hypothetical protein  28.76 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2981  putative lipoprotein  27.66 
 
 		 237 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3067  putative transmembrane lipoprotein  27.18 
 
 		 234 aa  52.8  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2124  lipoprotein transmembrane  27.8 
 
 		 213 aa  49.3  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.167848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1514  hypothetical protein  27.8 
 
 		 233 aa  48.5  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1941  lipoprotein transmembrane  24.88 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.418069  normal  0.0186336 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2264  putative lipoprotein transmembrane  24 
 
 		 222 aa  46.6  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0186714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1114  hypothetical protein  30.21 
 
 		 209 aa  46.6  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3470  hypothetical protein  27.8 
 
 		 205 aa  45.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0842044  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0879  hypothetical protein  33.04 
 
 		 233 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0891  hypothetical protein  33.04 
 
 		 233 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0975  hypothetical protein  27.23 
 
 		 236 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0629475 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1016  hypothetical protein  31.86 
 
 		 236 aa  42  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0537  hypothetical protein  31.86 
 
 		 236 aa  42  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0687  putative transmembrane lipoprotein  23.59 
 
 		 233 aa  41.6  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>