10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1146 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_1146  entericidin EcnAB  100 
 
 
98 aa  196  6e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.453448 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0875  entericidin EcnAB  72.73 
 
 
43 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.309715 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04018  entericidin A membrane lipoprotein, antidote entericidin B  52.78 
 
 
41 aa  40.8  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4390  entericidin A  52.78 
 
 
41 aa  40.8  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4705  entericidin A  52.78 
 
 
41 aa  40.8  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3864  entericidin A  52.78 
 
 
41 aa  40.8  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.316713 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4678  entericidin A  52.78 
 
 
41 aa  40.8  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5664  entericidin A  52.78 
 
 
41 aa  40.8  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.154356 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03980  hypothetical protein  52.78 
 
 
41 aa  40.8  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1920  entericidin EcnAB  44.12 
 
 
41 aa  40  0.01  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>