13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0150 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0150  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  308  2e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1879  putative secreted protein  29.41 
 
 
137 aa  54.7  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.562565  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0947  hypothetical protein  28.44 
 
 
195 aa  50.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.936738 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1762  hypothetical protein  28.95 
 
 
122 aa  49.7  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000014104  normal  0.309423 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5301  hypothetical protein  30.43 
 
 
126 aa  49.7  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5108  hypothetical protein  30.84 
 
 
129 aa  47  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1360  hypothetical protein  28.7 
 
 
125 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1070  hypothetical protein  26.55 
 
 
123 aa  45.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00610238  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1798  hypothetical protein  25.18 
 
 
166 aa  43.9  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0394364  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5385  hypothetical protein  25.69 
 
 
125 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1192  hypothetical protein  24.79 
 
 
242 aa  42.4  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0148  hypothetical protein  28.16 
 
 
153 aa  41.6  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2309  hypothetical protein  29.09 
 
 
181 aa  41.2  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00812325 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>