41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1531 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1531  major facilitator superfamily permease  100 
 
 
392 aa  770    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.01973  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2104  hypothetical protein  27 
 
 
405 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2144  hypothetical protein  27.5 
 
 
405 aa  137  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.494973  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2172  hypothetical protein  27 
 
 
405 aa  137  5e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1926  hypothetical protein  26.75 
 
 
409 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2073  hypothetical protein  26.75 
 
 
408 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1888  permease  26.75 
 
 
409 aa  133  5e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2062  hypothetical protein  26.93 
 
 
381 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0177999  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3245  macrolide-efflux protein  26.74 
 
 
340 aa  122  8e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0456931  normal  0.358053 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1878  permease  25.76 
 
 
408 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1539  major facilitator transporter  23.55 
 
 
412 aa  57  0.0000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000151531  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1559  major facilitator transporter  22.43 
 
 
412 aa  54.3  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000341731  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0369  major facilitator transporter  25.35 
 
 
418 aa  52  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.616869  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0367  sugar transporter  27.01 
 
 
410 aa  51.2  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000621781  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0376  major facilitator family transporter  26.98 
 
 
410 aa  50.4  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.118082  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0390  major facilitator family transporter  26.98 
 
 
410 aa  50.4  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0434  major facilitator family transporter  26.98 
 
 
410 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0364  sugar transporter  27.12 
 
 
410 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0504  major facilitator family transporter  27.68 
 
 
410 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.280977  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4868  major facilitator family transporter  26.98 
 
 
410 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3031  major facilitator transporter  22.01 
 
 
420 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0036629 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0456  major facilitator family transporter  26.44 
 
 
410 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0890515  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0504  major facilitator family transporter  25.86 
 
 
410 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0118  major facilitator superfamily MFS_1  24.28 
 
 
425 aa  47.4  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0371  major facilitator transporter  26.98 
 
 
405 aa  47.4  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3010  macrolide-efflux protein  24.45 
 
 
419 aa  46.6  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3276  putative permease  24.45 
 
 
419 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.550677  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19250  major facilitator superfamily MFS_1  24.44 
 
 
444 aa  46.2  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00108172  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3270  permease, putative  24.09 
 
 
419 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.719917  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1221  major facilitator transporter  22.73 
 
 
451 aa  44.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0719879 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2682  permease, putative  26.86 
 
 
440 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00193571  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3025  permease  24.09 
 
 
419 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3258  permease  24.09 
 
 
419 aa  44.7  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2947  macrolide-efflux protein  24.09 
 
 
419 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0495728  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4601  major facilitator superfamily MFS_1  27.78 
 
 
415 aa  43.9  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.621145  hitchhiker  0.00480988 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9059  hypothetical protein  21.68 
 
 
431 aa  43.9  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0598  major facilitator transporter  23.86 
 
 
427 aa  43.9  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000170409  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2649  permease  28.35 
 
 
412 aa  43.9  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.765576  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2468  permease  28.35 
 
 
412 aa  43.9  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000564968  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3246  putative permease  23.72 
 
 
419 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1864  major facilitator transporter  20.83 
 
 
417 aa  43.1  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.436032 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>