26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1817 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1817  primosomal replication protein n'', putative  100 
 
 		 222 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2472  primosomal replication protein N'', putative  95.95 
 
 		 222 aa  435  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169187 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2540  primosomal replication protein N'', putative  95.05 
 
 		 222 aa  432  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171474 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2632  primosomal replication protein N'', putative  95.5 
 
 		 222 aa  411  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.945  hitchhiker  0.00346674 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2727  primosomal replication protein N'', putative  85.91 
 
 		 220 aa  391  1e-108  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.794988  hitchhiker  0.000571866 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1650  primosomal replication protein N'', putative  85.91 
 
 		 220 aa  391  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.43387 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1616  primosomal replication protein N'', putative  85.91 
 
 		 220 aa  391  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.249114  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1627  primosomal replication protein N'', putative  85.91 
 
 		 220 aa  391  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1511  primosomal replication protein N'', putative  85 
 
 		 220 aa  387  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2632  primosomal replication protein N'', putative  66.82 
 
 		 220 aa  304  9.000000000000001e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2431  primosomal replication protein N'', putative  65.45 
 
 		 220 aa  302  3.0000000000000004e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1247  primosomal replication protein N'', putative  66.05 
 
 		 220 aa  295  4e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000103965 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1564  primosomal replication protein N'', putative  64.09 
 
 		 222 aa  289  2e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.857042  hitchhiker  0.0000269133 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3088  primosomal replication protein N'', putative  66.05 
 
 		 224 aa  290  2e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.647764  hitchhiker  0.0000204768 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2485  primosomal replication protein N'', putative  63.18 
 
 		 220 aa  287  1e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0159891 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2658  primosomal replication protein N'', putative  64.09 
 
 		 220 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3758  putative primosomal replication protein N''  24.74 
 
 		 227 aa  61.2  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1448  primosomal replication protein N``  26.16 
 
 		 187 aa  52.8  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000618679  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1073  Primosomal replication priB and priC  21.9 
 
 		 178 aa  44.7  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0102132  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3238  Primosomal replication priB and priC  22.54 
 
 		 178 aa  43.1  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104789  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1127  primosomal replication protein N''  21.91 
 
 		 186 aa  43.5  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1132  primosomal replication priB and priC  23.22 
 
 		 178 aa  42.7  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000181094 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003965  primosomal replication protein N''  23.92 
 
 		 181 aa  42.7  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0128436  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3202  primosomal replication priB and priC  22.07 
 
 		 178 aa  41.6  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2885  primosomal replication protein n''  22.07 
 
 		 178 aa  41.6  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0303464 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3062  primosomal replication protein n''  22.07 
 
 		 178 aa  41.6  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>