19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0675 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0675  prophage MuSo1, major head subunit, putative  100 
 
 		 306 aa  635    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2098  prophage MuSo1, major head subunit, putative  86.93 
 
 		 306 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.168211  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2144  prophage MuSo1, major head subunit, putative  86.93 
 
 		 306 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1637  hypothetical protein  43.52 
 
 		 303 aa  275  6e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0735  hypothetical protein  44.03 
 
 		 309 aa  273  3e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3001  major head subunit protein  45.72 
 
 		 298 aa  269  5.9999999999999995e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.751279  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1304  Mu-like prophage major head subunit gpT-like protein  43.56 
 
 		 298 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2096  Mu-like prophage major head subunit gpT-like protein  43.56 
 
 		 298 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.910977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0682  major head subunit  43.09 
 
 		 299 aa  241  1e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0755  major head subunit  43.09 
 
 		 299 aa  241  1e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1607  Mu-like prophage major head subunit gpT  38.94 
 
 		 298 aa  229  3e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.584098  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2685  prophage MuSo2, major head subunit, putative  42.05 
 
 		 299 aa  228  1e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3356  Mu-like prophage major head subunit gpT-like protein  41.91 
 
 		 296 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0095  hypothetical protein  40.55 
 
 		 299 aa  226  4e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.131989  normal  0.289582 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4497  Mu-like prophage major head subunit gpT-like protein  38.28 
 
 		 298 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.823943  normal  0.209482 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1882  Mu-like prophage major head subunit  38.82 
 
 		 293 aa  213  3.9999999999999995e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.448103 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2243  Mu-like prophage major head subunit gpT  37.67 
 
 		 293 aa  199  6e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1962  major head subunit protein  45.95 
 
 		 299 aa  151  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.248362 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0952  Mu-like protein prophage major head subunit gpT-like protein  30.07 
 
 		 307 aa  61.6  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000512523 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>