15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0669 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0669  prophage MuSo1, virion morphogenesis protein  100 
 
 		 150 aa  301  2.0000000000000002e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2091  phage virion morphogenesis protein  87.25 
 
 		 150 aa  266  8e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0471025  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2138  phage virion morphogenesis protein  86.58 
 
 		 150 aa  235  2e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.106619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0731  phage virion morphogenesis protein  39.61 
 
 		 160 aa  80.5  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2926  prophage MuMc02, virion morphogenesis protein  38.13 
 
 		 157 aa  78.6  0.00000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0435  phage virion morphogenesis protein  38.6 
 
 		 151 aa  73.2  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.337788  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4500  phage virion morphogenesis protein  31.65 
 
 		 176 aa  59.7  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124601 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1301  phage virion morphogenesis protein  30.57 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2099  phage virion morphogenesis protein  30.57 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.544924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3785  phage virion morphogenesis (putative tail completion) protein  26.55 
 
 		 179 aa  52.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2997  Mu-like prophage protein  27.81 
 
 		 191 aa  52.4  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.151432  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1879  phage virion morphogenesis protein  25.29 
 
 		 168 aa  47  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2690  prophage MuSo2, virion morphogenesis protein, putative  28.38 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1639  putative bacteriophage protein  27.5 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1290  phage virion morphogenesis protein  26.14 
 
 		 148 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.47294e-24 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>