18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP2540 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP2540  hypothetical protein  100 
 
 
308 aa  604  9.999999999999999e-173  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0013  hypothetical protein  69.16 
 
 
312 aa  423  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0013  hypothetical protein  69.16 
 
 
312 aa  423  1e-117  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3414  IG hypothetical 15508  25.17 
 
 
308 aa  88.2  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00386324  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5264  hypothetical protein  25.16 
 
 
311 aa  67  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.165043  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5659  hypothetical protein  25.4 
 
 
312 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000108758  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5581  hypothetical protein  25.64 
 
 
312 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.747160000000001e-18 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3543  hypothetical protein  22.18 
 
 
308 aa  65.1  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5168  hypothetical protein  26.69 
 
 
312 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.190571  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5152  hypothetical protein  26.37 
 
 
312 aa  63.5  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000091778  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5324  hypothetical protein  26.37 
 
 
312 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.859354  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5720  hypothetical protein  26.37 
 
 
312 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000676136  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5598  hypothetical protein  25.52 
 
 
311 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0121359  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5337  hypothetical protein  24.48 
 
 
311 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000137644  hitchhiker  0.000000122299 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4011  hypothetical protein  24.67 
 
 
312 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0458856  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5622  hypothetical protein  26.03 
 
 
311 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.020509  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3186  hypothetical protein  21.55 
 
 
325 aa  50.8  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.46732  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0653  membrane protein-like protein  23.55 
 
 
319 aa  46.2  0.0008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.547059  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>