27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1932 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1932  hypothetical protein  100 
 
 
267 aa  531  1e-150  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4643  hypothetical protein  20.87 
 
 
290 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4268  hypothetical protein  22.15 
 
 
289 aa  55.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.109738  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4429  hypothetical protein  21.48 
 
 
289 aa  53.5  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.573991  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4771  hypothetical protein  21.48 
 
 
289 aa  53.5  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.6863  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4657  hypothetical protein  22.45 
 
 
289 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4658  hypothetical protein  22.45 
 
 
289 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4279  hypothetical protein  21.65 
 
 
289 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.927938  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3800  hypothetical protein  21.43 
 
 
267 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2345  hypothetical protein  22.97 
 
 
266 aa  50.8  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4645  hypothetical protein  22.82 
 
 
290 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1711  hypothetical protein  31.03 
 
 
369 aa  48.9  0.00008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.597289  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2016  hypothetical protein  20.96 
 
 
280 aa  47.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.164991  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1515  hypothetical protein  21.43 
 
 
267 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.113881 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0467  hypothetical protein  25.1 
 
 
290 aa  48.1  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00461802 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1983  hypothetical protein  20.96 
 
 
280 aa  47.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0252  hypothetical protein  26.85 
 
 
238 aa  46.6  0.0005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0316112  normal  0.0914513 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5648  hypothetical protein  22.22 
 
 
269 aa  45.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.343827  normal  0.189462 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3709  hypothetical protein  21.43 
 
 
268 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.12968e-17 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1968  hypothetical protein  21.77 
 
 
310 aa  44.3  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1470  hypothetical protein  22.41 
 
 
278 aa  43.5  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000331353  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3378  hypothetical protein  21.61 
 
 
267 aa  43.9  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157307  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3751  hypothetical protein  21.43 
 
 
268 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3755  hypothetical protein  21.43 
 
 
267 aa  42.7  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3728  hypothetical protein  22.14 
 
 
268 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3481  hypothetical protein  21.43 
 
 
268 aa  42.4  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.02728  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1723  hypothetical protein  24.21 
 
 
289 aa  42  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>