49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP0673 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0673  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  100 
 
 		 338 aa  672    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1169  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit II  82.54 
 
 		 339 aa  515  1.0000000000000001e-145  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.171142  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1147  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 2-like protein  82.54 
 
 		 339 aa  515  1.0000000000000001e-145  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2909  cytochrome bd-type ubiquinol oxidase subunit II  50.3 
 
 		 342 aa  291  1e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0553  cytochrome bd-type ubiquinol oxidase subunit II  51.81 
 
 		 337 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.128418  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0578  cytochrome bd-type quinol oxidase, subunit 2  35.06 
 
 		 343 aa  181  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3761  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit II  34.83 
 
 		 341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5614  putative cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 341 aa  168  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000139599 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4918  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 341 aa  167  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5339  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II, putative  33.93 
 
 		 341 aa  167  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4906  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 341 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5016  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 341 aa  165  9e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5396  putative cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  33.63 
 
 		 341 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5461  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit II  33.33 
 
 		 341 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5074  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit II  33.33 
 
 		 341 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5314  putative cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 341 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.8662400000000005e-24 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5345  putative cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  33.03 
 
 		 341 aa  157  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2681  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II-related protein  31.88 
 
 		 287 aa  103  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000218103  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4082  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II-related protein  33.21 
 
 		 288 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1158  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II-related protein  33.21 
 
 		 288 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.199535  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3889  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit II-related protein  32.12 
 
 		 288 aa  94.4  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.52537  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3994  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II-related protein  32.12 
 
 		 288 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3721  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit II-like protein  32.12 
 
 		 288 aa  94.4  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.261957  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4192  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit II-related protein  32.12 
 
 		 288 aa  94.4  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3737  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit II-like protein  32.12 
 
 		 288 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4099  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II-related protein  32.12 
 
 		 288 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000497736  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4028  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II-related protein  32.12 
 
 		 288 aa  94  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.955139  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1111  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit II  26.15 
 
 		 337 aa  91.7  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3806  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit II-like protein  30.66 
 
 		 288 aa  90.1  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.155775  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0257  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  23.75 
 
 		 330 aa  69.7  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.794868 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2017  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit II  24.46 
 
 		 347 aa  65.9  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6579  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit II  23.8 
 
 		 330 aa  60.8  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3724  Cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 2- like protein  28.57 
 
 		 424 aa  56.6  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.77992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2202  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit II  24.24 
 
 		 349 aa  56.2  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000104234 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1001  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit II  20.59 
 
 		 338 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.954377  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0940  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  21.3 
 
 		 338 aa  53.5  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.528842  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2687  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  25.97 
 
 		 345 aa  53.5  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0998  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit II  20.59 
 
 		 338 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.4016  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2591  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit II  21.59 
 
 		 337 aa  50.8  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1394  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit II  27.88 
 
 		 339 aa  50.1  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0429181 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7913  terminal oxidase subunit II  21.35 
 
 		 337 aa  49.7  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.346178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5646  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit II  26.92 
 
 		 341 aa  47.4  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.965151  normal  0.688925 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0303  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit II  20.68 
 
 		 338 aa  47.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2613  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit II  27.88 
 
 		 339 aa  47.4  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.251199 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2244  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit II  22.64 
 
 		 336 aa  46.6  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.171072  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000808  putative Cytochrome bd2 subunit II  22.69 
 
 		 332 aa  46.2  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1675  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  22.19 
 
 		 337 aa  44.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.186324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0174  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit II  22.29 
 
 		 337 aa  44.3  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.132519  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5725  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit II  19.81 
 
 		 335 aa  43.5  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.31475  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>