23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0417 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0417  hypothetical protein  100 
 
 
267 aa  520  1e-146  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2012  ferric iron reductase  32 
 
 
278 aa  95.5  8e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0301477  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1740  hypothetical protein  29.39 
 
 
270 aa  93.6  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4381  hypothetical protein  34.85 
 
 
315 aa  89.7  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.674534  normal  0.102983 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0334  hypothetical protein  30.67 
 
 
271 aa  80.9  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2756  hypothetical protein  29.49 
 
 
236 aa  72.8  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0191  hypothetical protein  26.28 
 
 
364 aa  70.5  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1523  hypothetical protein  32.82 
 
 
286 aa  70.5  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.1234  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1858  hypothetical protein  31.34 
 
 
288 aa  65.1  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0143985  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3495  ferric iron reductase  29.24 
 
 
251 aa  52.4  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.495809  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4117  hypothetical protein  28.96 
 
 
263 aa  52  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4538  hypothetical protein  27.31 
 
 
259 aa  48.5  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5551  hypothetical protein  29.08 
 
 
341 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.13158 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4042  ferric iron reductase  26.79 
 
 
264 aa  46.2  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09690  hypothetical protein  30.71 
 
 
224 aa  46.2  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.95344  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4783  ferric iron reductase  30.61 
 
 
267 aa  45.8  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.200161  normal  0.899334 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1534  ferric iron reductase  32.12 
 
 
266 aa  45.8  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.75472  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1983  ferric iron reductase  22.39 
 
 
248 aa  45.4  0.0009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000850191  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2298  hypothetical protein  31.58 
 
 
268 aa  45.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86362  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1555  ferric iron reductase  32.12 
 
 
266 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.494875  normal  0.652655 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3544  hypothetical protein  27.49 
 
 
276 aa  43.9  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0527  ferric iron reductase  34.91 
 
 
253 aa  42  0.01  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1612  ferric iron reductase  28.91 
 
 
266 aa  42  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.113316  normal  0.0645299 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>