12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3703 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3703  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  267  4e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.780852 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3183  hypothetical protein  82.14 
 
 
177 aa  218  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1187  hypothetical protein  29.13 
 
 
323 aa  59.7  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1122  hypothetical protein  37.5 
 
 
280 aa  51.2  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.202357  normal  0.329885 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0441  hypothetical protein  35.21 
 
 
221 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0790012  normal  0.469001 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0306  hypothetical protein  32.93 
 
 
212 aa  47.8  0.00005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.54292  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1270  hypothetical protein  31.51 
 
 
277 aa  47.4  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.141795  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1323  hypothetical protein  36.99 
 
 
277 aa  47.4  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.598167  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0236  hypothetical protein  34.78 
 
 
160 aa  45.1  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0144969  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1250  hypothetical protein  28.07 
 
 
280 aa  43.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00375615  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0843  hypothetical protein  32.31 
 
 
278 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000182061  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1745  hypothetical protein  28.57 
 
 
175 aa  41.2  0.005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.535818  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>