14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3183 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3183  hypothetical protein  100 
 
 		 177 aa  346  1e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3703  hypothetical protein  82.14 
 
 		 140 aa  218  5e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.780852 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1187  hypothetical protein  29.82 
 
 		 323 aa  59.3  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1122  hypothetical protein  38.89 
 
 		 280 aa  58.5  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.202357  normal  0.329885 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1323  hypothetical protein  37.5 
 
 		 277 aa  54.7  0.0000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.598167  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1270  hypothetical protein  31.94 
 
 		 277 aa  53.5  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.141795  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0441  hypothetical protein  36.62 
 
 		 221 aa  52.8  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0790012  normal  0.469001 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0236  hypothetical protein  34.78 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0144969  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0306  hypothetical protein  28.04 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.54292  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1745  hypothetical protein  35.21 
 
 		 175 aa  46.2  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.535818  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0435  hypothetical protein  33.33 
 
 		 277 aa  43.1  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0843  hypothetical protein  24.59 
 
 		 278 aa  42.4  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000182061  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1744  hypothetical protein  32.86 
 
 		 273 aa  42  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0480731 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1250  hypothetical protein  27.19 
 
 		 280 aa  42  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00375615  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>