25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2876 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2876  antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 
105 aa  219  9e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.543619  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2086  putative antibiotic biosynthesis monooxygenase  90.38 
 
 
105 aa  201  4e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0761  antibiotic biosynthesis monooxygenase  90.38 
 
 
105 aa  201  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.635476  normal  0.97027 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2214  hypothetical protein  69.9 
 
 
109 aa  153  7e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2266  antibiotic biosynthesis monooxygenase  73.91 
 
 
106 aa  149  1e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0358848  normal  0.992852 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1305  antibiotic biosynthesis monooxygenase  57.84 
 
 
107 aa  134  4e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.675422  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1591  antibiotic biosynthesis monooxygenase  57.84 
 
 
107 aa  134  4e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.768665  normal  0.0150332 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2139  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40 
 
 
111 aa  80.9  0.000000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0769988  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1914  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40 
 
 
120 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.111994  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1960  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40 
 
 
109 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1894  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40 
 
 
109 aa  72  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.407369 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0385  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.11 
 
 
110 aa  53.5  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531234  normal  0.0179673 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1704  hypothetical protein  34.04 
 
 
146 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.653173  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1686  hypothetical protein  34.04 
 
 
146 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2527  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.98 
 
 
103 aa  51.6  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00497835  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5024  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.47 
 
 
108 aa  49.7  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5360  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.61 
 
 
122 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000102648  normal  0.0637675 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6490  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.89 
 
 
108 aa  44.7  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2200  hypothetical protein  32.18 
 
 
247 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.573449  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35160  hypothetical protein  44.44 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2966  hypothetical protein  44.44 
 
 
125 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.159734  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0764  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.59 
 
 
122 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00475722  hitchhiker  0.0000687435 
 
 
 
NC_007492  Pfl01_3919  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.94 
 
 
121 aa  41.2  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.821811  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4927  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30 
 
 
122 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111834  normal  0.0525996 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3440  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30 
 
 
122 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.000000000008426  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>