62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2575 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2575  hypothetical protein  100 
 
 		 218 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0291416 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1671  hypothetical protein  84.69 
 
 		 218 aa  348  5e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0304  hypothetical protein  84.69 
 
 		 218 aa  348  5e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.785913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1399  hypothetical protein  55.17 
 
 		 218 aa  231  5e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.313439 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0515  hypothetical protein  52.43 
 
 		 210 aa  206  1e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0195  hypothetical protein  51.16 
 
 		 218 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2564  hypothetical protein  45.75 
 
 		 234 aa  162  3e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.164456  hitchhiker  0.00170184 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2870  hypothetical protein  34.98 
 
 		 208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0163842 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1855  hypothetical protein  33.8 
 
 		 210 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1148  hypothetical protein  36.27 
 
 		 196 aa  95.1  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0995  hypothetical protein  35.42 
 
 		 196 aa  94  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.855754 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5943  hypothetical protein  37.57 
 
 		 177 aa  92.8  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0572526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0470  hypothetical protein  28.08 
 
 		 200 aa  89  5e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0466774  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0947  hypothetical protein  36.84 
 
 		 177 aa  89  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2630  hypothetical protein  32.21 
 
 		 191 aa  87.8  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.662517  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0679  hypothetical protein  34.39 
 
 		 210 aa  86.7  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0658  hypothetical protein  40 
 
 		 190 aa  79.3  0.00000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.381208  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0651  hypothetical protein  40 
 
 		 190 aa  79.3  0.00000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.849018  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3779  hypothetical protein  32.32 
 
 		 159 aa  68.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1133  hypothetical protein  29.72 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1583  hypothetical protein  28.05 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4776  hypothetical protein  36.78 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1849  hypothetical protein  37.93 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0502  hypothetical protein  27.72 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000282211 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1362  hypothetical protein  28.27 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4179  hypothetical protein  26.09 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764127 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2062  hypothetical protein  27.96 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.687582  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3864  uncharacterized protein-like protein  29.73 
 
 		 160 aa  53.9  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3780  uncharacterized protein-like protein  29.73 
 
 		 160 aa  52.8  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0161725  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0526  hypothetical protein  34.09 
 
 		 165 aa  51.6  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.983156  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25470  hypothetical protein  22.46 
 
 		 177 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1729  hypothetical protein  34.82 
 
 		 221 aa  50.8  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.817068 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2176  hypothetical protein  22.46 
 
 		 177 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1250  hypothetical protein  30.77 
 
 		 186 aa  50.8  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1386  hypothetical protein  35.8 
 
 		 151 aa  50.1  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.01232  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0515  hypothetical protein  31.86 
 
 		 191 aa  50.1  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838084  normal  0.7935 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2148  hypothetical protein  28.12 
 
 		 171 aa  50.1  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.446802 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27551  hypothetical protein  28.32 
 
 		 167 aa  49.7  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14720  hypothetical protein  26.92 
 
 		 175 aa  49.7  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00102497  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3130  hypothetical protein  40.54 
 
 		 160 aa  48.9  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0121568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3586  hypothetical protein  39.29 
 
 		 165 aa  48.9  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000285245  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0390  hypothetical protein  37.66 
 
 		 160 aa  47.8  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.371828  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2163  putative membrane protein with signal peptide  36.59 
 
 		 181 aa  48.1  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000423148  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03835  dolichyl-phosphate mannose synthase-like protein  24.24 
 
 		 397 aa  47  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.125771  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3818  hypothetical protein  25.36 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1507  hypothetical protein  26.09 
 
 		 208 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4133  hypothetical protein  36.36 
 
 		 160 aa  46.2  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000340149  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2137  hypothetical protein  36.46 
 
 		 162 aa  45.8  0.0005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1079  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 		 395 aa  45.4  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2465  hypothetical protein  24.48 
 
 		 169 aa  45.4  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000697447  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0737  membrane protein  41.18 
 
 		 174 aa  45.4  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1471  hypothetical protein  29.49 
 
 		 176 aa  45.1  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0342  hypothetical protein  28.95 
 
 		 209 aa  44.7  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0147738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1472  hypothetical protein  26.09 
 
 		 212 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1745  hypothetical protein  29.41 
 
 		 163 aa  43.5  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1584  hypothetical protein  28.99 
 
 		 185 aa  43.1  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.452951  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2123  hypothetical protein  30.43 
 
 		 169 aa  43.1  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2731  hypothetical protein  32.93 
 
 		 176 aa  42.7  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2454  hypothetical protein  40.91 
 
 		 146 aa  42.7  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0633  hypothetical protein  25.77 
 
 		 177 aa  42.4  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1610  hypothetical protein  31.34 
 
 		 175 aa  42.4  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0380399  normal  0.147771 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0394  hypothetical protein  31.79 
 
 		 180 aa  42  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>