20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1304 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1304  Mu-like prophage major head subunit gpT-like protein  100 
 
 		 298 aa  611  9.999999999999999e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2096  Mu-like prophage major head subunit gpT-like protein  100 
 
 		 298 aa  611  9.999999999999999e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.910977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3356  Mu-like prophage major head subunit gpT-like protein  71.04 
 
 		 296 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4497  Mu-like prophage major head subunit gpT-like protein  64.43 
 
 		 298 aa  391  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.823943  normal  0.209482 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3001  major head subunit protein  55.52 
 
 		 298 aa  345  4e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.751279  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1607  Mu-like prophage major head subunit gpT  52.86 
 
 		 298 aa  336  1.9999999999999998e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.584098  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0095  hypothetical protein  44.63 
 
 		 299 aa  282  4.0000000000000003e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.131989  normal  0.289582 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1637  hypothetical protein  45.87 
 
 		 303 aa  281  9e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1882  Mu-like prophage major head subunit  48.16 
 
 		 293 aa  270  2.9999999999999997e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.448103 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2144  prophage MuSo1, major head subunit, putative  45.54 
 
 		 306 aa  257  1e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2098  prophage MuSo1, major head subunit, putative  45.21 
 
 		 306 aa  256  3e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.168211  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0675  prophage MuSo1, major head subunit, putative  43.56 
 
 		 306 aa  251  1e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0735  hypothetical protein  42.81 
 
 		 309 aa  245  6.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2243  Mu-like prophage major head subunit gpT  41.79 
 
 		 293 aa  219  6e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0755  major head subunit  37.58 
 
 		 299 aa  206  5e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0682  major head subunit  37.58 
 
 		 299 aa  206  5e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2685  prophage MuSo2, major head subunit, putative  38.26 
 
 		 299 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1962  major head subunit protein  47.3 
 
 		 299 aa  139  7.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.248362 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0952  Mu-like protein prophage major head subunit gpT-like protein  23.59 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000512523 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1974  Mu-like prophage major head subunit gpT  50 
 
 		 61 aa  56.2  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.319601 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>