11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4546 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4546  hypothetical protein  100 
 
 		 51 aa  89  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3474  hypothetical protein  100 
 
 		 51 aa  89  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0167723  normal  0.141558 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2168  hypothetical protein  69.44 
 
 		 50 aa  53.5  0.0000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3331  hypothetical protein  66 
 
 		 52 aa  50.4  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.449636  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2300  hypothetical protein  60 
 
 		 50 aa  46.6  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.78628  normal  0.0803488 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4156  hypothetical protein  59.38 
 
 		 51 aa  44.7  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2140  hypothetical protein  70 
 
 		 52 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.635933  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2127  hypothetical protein  70 
 
 		 52 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.071292  normal  0.529379 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0444  hypothetical protein  87.5 
 
 		 51 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7233  hypothetical protein  81.25 
 
 		 51 aa  40.8  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0060  hypothetical protein  74.19 
 
 		 76 aa  40  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.517772 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>