22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3699 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010682  Rpic_3699  hypothetical protein  100 
 
 
182 aa  352  2e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3376  membrane-bound metal-dependent hydrolase  98.35 
 
 
182 aa  348  3e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3592  hypothetical protein  69.62 
 
 
174 aa  192  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1851  hypothetical protein  70.06 
 
 
174 aa  187  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.163042 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3883  hypothetical protein  63.29 
 
 
185 aa  184  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.372764  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4415  hypothetical protein  67.09 
 
 
174 aa  178  4e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4289  membrane-bound metal-dependent hydrolase  71.22 
 
 
171 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.208948 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4594  hypothetical protein  64.74 
 
 
174 aa  176  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.238145  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0618  hypothetical protein  71.43 
 
 
172 aa  176  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0268751 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4067  hypothetical protein  68.55 
 
 
174 aa  174  6e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0208636  normal  0.9668 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4186  hypothetical protein  64.94 
 
 
174 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.48428  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4180  hypothetical protein  64.94 
 
 
174 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.84562  normal  0.337483 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3337  hypothetical protein  64.94 
 
 
174 aa  173  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1741  hypothetical protein  71.63 
 
 
172 aa  170  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0631778  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0372  hypothetical protein  70.92 
 
 
172 aa  166  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0329059  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0267  hypothetical protein  70.92 
 
 
172 aa  166  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1826  hypothetical protein  70.92 
 
 
172 aa  166  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.437082  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1329  hypothetical protein  70.92 
 
 
172 aa  166  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.190348  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0300  hypothetical protein  70.92 
 
 
172 aa  166  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.861833  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0995  hypothetical protein  70.92 
 
 
172 aa  166  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0588221  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1133  hypothetical protein  69.5 
 
 
172 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.215518  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4474  membrane-bound metal-dependent hydrolase  35.56 
 
 
153 aa  54.3  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>